科技导报
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과기도보
SCIENCE & TECHNOLOGY REVIEW
2006年
5期
16-24
,共9页
薛付忠%王洁贞%郭亦寿%胡平
薛付忠%王潔貞%郭亦壽%鬍平
설부충%왕길정%곽역수%호평
人类群体遗传结构%PPG双标图模型%HLA-A基因座%汉族群体
人類群體遺傳結構%PPG雙標圖模型%HLA-A基因座%漢族群體
인류군체유전결구%PPG쌍표도모형%HLA-A기인좌%한족군체
提出了分析人类群体遗传结构的PPG双标图模型的基本原理及其应用.PPG双标图根据人类群体遗传学的基本原理,利用矩阵奇异值分解技术,将多维基因频率矩阵近似为一个能够用双标图表示的二维矩阵,从而实现了人类群体遗传结构的图形化和可视化直观分析.它与聚类分析、主成分分析、对应分析等传统多元统计分析方法相比,具有明显的优越性.PPG双标图通过其几何性质,反映了其丰富的群体遗传学含义;更重要的是,在基因频率矩阵前2项奇异值的累计贡献率足够大的前提下,利用双标图,以辅助线为补充,可以实现人类群体遗传结构的可视化直观定量分析:①比较各群体之间的遗传距离,划分群体类型;②比较各基因的变异性大小;③分析各基因之间的相关性;④比较某基因对各亚群体遗传结构的相对贡献;⑤比较任意2个亚群体遗传结构的差异;⑥分析任意2个基因的差异及其对各亚群体变异性的贡献;⑦分析群体与基因的交互作用及其对群体亚分的贡献.因此,PPG双标图值得在人类群体遗传结构分析中推广应用,但PPG双标图也存在一定的局限性.
提齣瞭分析人類群體遺傳結構的PPG雙標圖模型的基本原理及其應用.PPG雙標圖根據人類群體遺傳學的基本原理,利用矩陣奇異值分解技術,將多維基因頻率矩陣近似為一箇能夠用雙標圖錶示的二維矩陣,從而實現瞭人類群體遺傳結構的圖形化和可視化直觀分析.它與聚類分析、主成分分析、對應分析等傳統多元統計分析方法相比,具有明顯的優越性.PPG雙標圖通過其幾何性質,反映瞭其豐富的群體遺傳學含義;更重要的是,在基因頻率矩陣前2項奇異值的纍計貢獻率足夠大的前提下,利用雙標圖,以輔助線為補充,可以實現人類群體遺傳結構的可視化直觀定量分析:①比較各群體之間的遺傳距離,劃分群體類型;②比較各基因的變異性大小;③分析各基因之間的相關性;④比較某基因對各亞群體遺傳結構的相對貢獻;⑤比較任意2箇亞群體遺傳結構的差異;⑥分析任意2箇基因的差異及其對各亞群體變異性的貢獻;⑦分析群體與基因的交互作用及其對群體亞分的貢獻.因此,PPG雙標圖值得在人類群體遺傳結構分析中推廣應用,但PPG雙標圖也存在一定的跼限性.
제출료분석인류군체유전결구적PPG쌍표도모형적기본원리급기응용.PPG쌍표도근거인류군체유전학적기본원리,이용구진기이치분해기술,장다유기인빈솔구진근사위일개능구용쌍표도표시적이유구진,종이실현료인류군체유전결구적도형화화가시화직관분석.타여취류분석、주성분분석、대응분석등전통다원통계분석방법상비,구유명현적우월성.PPG쌍표도통과기궤하성질,반영료기봉부적군체유전학함의;경중요적시,재기인빈솔구진전2항기이치적루계공헌솔족구대적전제하,이용쌍표도,이보조선위보충,가이실현인류군체유전결구적가시화직관정량분석:①비교각군체지간적유전거리,화분군체류형;②비교각기인적변이성대소;③분석각기인지간적상관성;④비교모기인대각아군체유전결구적상대공헌;⑤비교임의2개아군체유전결구적차이;⑥분석임의2개기인적차이급기대각아군체변이성적공헌;⑦분석군체여기인적교호작용급기대군체아분적공헌.인차,PPG쌍표도치득재인류군체유전결구분석중추엄응용,단PPG쌍표도야존재일정적국한성.