西北林学院学报
西北林學院學報
서북림학원학보
JOURNAL OF NORTHWEST FORESTRY UNIVERSITY
2011年
6期
56-61,113
,共7页
黄娟%安锋%庄海燕%喻修道%张硕新
黃娟%安鋒%莊海燕%喻脩道%張碩新
황연%안봉%장해연%유수도%장석신
橡胶树%水通道蛋白%PCR%RACE%序列分析
橡膠樹%水通道蛋白%PCR%RACE%序列分析
상효수%수통도단백%PCR%RACE%서렬분석
根据GenBank中已经公布的不同植物水通道蛋白(AQPs)的保守氨基酸序列设计简并引物,结合RT-PCR和RACE技术,从橡胶树(Hevea brasiliensis)中克隆了2个AQP基因的全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析.结果获得橡胶树2个AQPs基因的全长,分别命名为HbPIP1；2和HbPIP2;2.HbPIP1；2编码273个氨基酸,理论分子量为29.15 kD,等电点为8.55；HbPIP2；2编码278个氨基酸,理论分子量为29.78 kD,等电点为8.20.HbPIP1；2和HbPIP2;2均具有6个跨膜区和MIP家族信号序列SGXHXNPAVT,为疏水性蛋白；HbPIP1;2和HbPIP2;2与同科蓖麻水通道蛋白基因RcPIP1 -3和RcPIP2-1的同源性分别为91％和89％,并具有相同功能域.因此,推测Hb-PIP1；2和HbPIP2;2都属于水通道蛋白基因家族的新成员.
根據GenBank中已經公佈的不同植物水通道蛋白(AQPs)的保守氨基痠序列設計簡併引物,結閤RT-PCR和RACE技術,從橡膠樹(Hevea brasiliensis)中剋隆瞭2箇AQP基因的全長cDNA序列,併對其進行生物信息學分析.結果穫得橡膠樹2箇AQPs基因的全長,分彆命名為HbPIP1；2和HbPIP2;2.HbPIP1；2編碼273箇氨基痠,理論分子量為29.15 kD,等電點為8.55；HbPIP2；2編碼278箇氨基痠,理論分子量為29.78 kD,等電點為8.20.HbPIP1；2和HbPIP2;2均具有6箇跨膜區和MIP傢族信號序列SGXHXNPAVT,為疏水性蛋白；HbPIP1;2和HbPIP2;2與同科蓖痳水通道蛋白基因RcPIP1 -3和RcPIP2-1的同源性分彆為91％和89％,併具有相同功能域.因此,推測Hb-PIP1；2和HbPIP2;2都屬于水通道蛋白基因傢族的新成員.
근거GenBank중이경공포적불동식물수통도단백(AQPs)적보수안기산서렬설계간병인물,결합RT-PCR화RACE기술,종상효수(Hevea brasiliensis)중극륭료2개AQP기인적전장cDNA서렬,병대기진행생물신식학분석.결과획득상효수2개AQPs기인적전장,분별명명위HbPIP1；2화HbPIP2;2.HbPIP1；2편마273개안기산,이론분자량위29.15 kD,등전점위8.55；HbPIP2；2편마278개안기산,이론분자량위29.78 kD,등전점위8.20.HbPIP1；2화HbPIP2;2균구유6개과막구화MIP가족신호서렬SGXHXNPAVT,위소수성단백；HbPIP1;2화HbPIP2;2여동과비마수통도단백기인RcPIP1 -3화RcPIP2-1적동원성분별위91％화89％,병구유상동공능역.인차,추측Hb-PIP1；2화HbPIP2;2도속우수통도단백기인가족적신성원.
