病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2007年
4期
312-319
,共8页
鸭肝炎病毒%3D基因%3'UTR%poly(A)%3'RACE
鴨肝炎病毒%3D基因%3'UTR%poly(A)%3'RACE
압간염병독%3D기인%3'UTR%poly(A)%3'RACE
用3'RACE和RT-PCR扩增并克隆鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ型毒株C80和Ⅰ型变异株E63的3'末端序列.分析结果显示,C80株和E63株基因组3'末端均包含1 359 nt的3D、终止密码子TGA、长314nt的3'UTR,而poly(A)尾分别含18个A和19个A.由2株DHV 3D核苷酸序列所推导的3D蛋白均含453个氨基酸,均包含KDELR、DxxxxD、GxxCSGxxxTxxxNS、YGDD和FLKR等小RNA病毒RNA聚合酶的特征基序,该结果进一步证实Ⅰ型DHV属于小RNA病毒科的成员.两株DHV与小RNA病毒科9个已知属之间3D蛋白的氨基酸序列同源性为16%～37%,介于属间3D蛋白的氨基酸序列同源性范围(18%～60%)之内;此外,Ⅰ型DHV的3'UTR在小RNA病毒科是最长的.用3D蛋白进行进化分析的结果表明,Ⅰ型DHV可能属于小RNA病毒科的一个独立的病毒属.
用3'RACE和RT-PCR擴增併剋隆鴨肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ型毒株C80和Ⅰ型變異株E63的3'末耑序列.分析結果顯示,C80株和E63株基因組3'末耑均包含1 359 nt的3D、終止密碼子TGA、長314nt的3'UTR,而poly(A)尾分彆含18箇A和19箇A.由2株DHV 3D覈苷痠序列所推導的3D蛋白均含453箇氨基痠,均包含KDELR、DxxxxD、GxxCSGxxxTxxxNS、YGDD和FLKR等小RNA病毒RNA聚閤酶的特徵基序,該結果進一步證實Ⅰ型DHV屬于小RNA病毒科的成員.兩株DHV與小RNA病毒科9箇已知屬之間3D蛋白的氨基痠序列同源性為16%～37%,介于屬間3D蛋白的氨基痠序列同源性範圍(18%～60%)之內;此外,Ⅰ型DHV的3'UTR在小RNA病毒科是最長的.用3D蛋白進行進化分析的結果錶明,Ⅰ型DHV可能屬于小RNA病毒科的一箇獨立的病毒屬.
용3'RACE화RT-PCR확증병극륭압간염병독(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ형독주C80화Ⅰ형변이주E63적3'말단서렬.분석결과현시,C80주화E63주기인조3'말단균포함1 359 nt적3D、종지밀마자TGA、장314nt적3'UTR,이poly(A)미분별함18개A화19개A.유2주DHV 3D핵감산서렬소추도적3D단백균함453개안기산,균포함KDELR、DxxxxD、GxxCSGxxxTxxxNS、YGDD화FLKR등소RNA병독RNA취합매적특정기서,해결과진일보증실Ⅰ형DHV속우소RNA병독과적성원.량주DHV여소RNA병독과9개이지속지간3D단백적안기산서렬동원성위16%～37%,개우속간3D단백적안기산서렬동원성범위(18%～60%)지내;차외,Ⅰ형DHV적3'UTR재소RNA병독과시최장적.용3D단백진행진화분석적결과표명,Ⅰ형DHV가능속우소RNA병독과적일개독립적병독속.
