应用与环境生物学报
應用與環境生物學報
응용여배경생물학보
CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY
2006年
1期
64-67
,共4页
黄志鹏%关春鸿%黄必旺%邱君志%关雄
黃誌鵬%關春鴻%黃必旺%邱君誌%關雄
황지붕%관춘홍%황필왕%구군지%관웅
苏云金芽孢杆菌%cry1Ab17基因%克隆%生物信息学
囌雲金芽孢桿菌%cry1Ab17基因%剋隆%生物信息學
소운금아포간균%cry1Ab17기인%극륭%생물신식학
利用高效克隆PCR产物的专用载体pMD18-T,直接从苏云金芽孢杆菌WB9的PCR产物中克隆了cry1Ab17新基因.测序结果表明,该基因(GenBank登录号为AY646166)由3 471个碱基组成,其编码的蛋白质含有1 156个氨基酸残基,其中亲水性氨基酸占30.8%,疏水性氨基酸占45.2%,酸性氨基酸占12.9%,碱性氨基酸占11.1%.氨基酸序列的同源性分析结果表明,Cry1Ab17蛋白与已报道的Cry1Ab蛋白同源性为95.4%~99.7%,该蛋白的4个氨基酸残基--Pro170、Gly449、Gly796和Gly863与其它已报道Cry1Ab蛋白相应位置的氨基酸残基均不同.在核苷酸序列和氨基酸序列多重比较的基础上,应用PAUP 4.0构建了Cry1A蛋白家族的系统发育树.SignalP分析结果显示,Cry1Ab17蛋白中不含信号肽序列.此外,对Cry1Ab17蛋白的二级结构和3个结构域也进行了预测和分析.图4表2参15
利用高效剋隆PCR產物的專用載體pMD18-T,直接從囌雲金芽孢桿菌WB9的PCR產物中剋隆瞭cry1Ab17新基因.測序結果錶明,該基因(GenBank登錄號為AY646166)由3 471箇堿基組成,其編碼的蛋白質含有1 156箇氨基痠殘基,其中親水性氨基痠佔30.8%,疏水性氨基痠佔45.2%,痠性氨基痠佔12.9%,堿性氨基痠佔11.1%.氨基痠序列的同源性分析結果錶明,Cry1Ab17蛋白與已報道的Cry1Ab蛋白同源性為95.4%~99.7%,該蛋白的4箇氨基痠殘基--Pro170、Gly449、Gly796和Gly863與其它已報道Cry1Ab蛋白相應位置的氨基痠殘基均不同.在覈苷痠序列和氨基痠序列多重比較的基礎上,應用PAUP 4.0構建瞭Cry1A蛋白傢族的繫統髮育樹.SignalP分析結果顯示,Cry1Ab17蛋白中不含信號肽序列.此外,對Cry1Ab17蛋白的二級結構和3箇結構域也進行瞭預測和分析.圖4錶2參15
이용고효극륭PCR산물적전용재체pMD18-T,직접종소운금아포간균WB9적PCR산물중극륭료cry1Ab17신기인.측서결과표명,해기인(GenBank등록호위AY646166)유3 471개감기조성,기편마적단백질함유1 156개안기산잔기,기중친수성안기산점30.8%,소수성안기산점45.2%,산성안기산점12.9%,감성안기산점11.1%.안기산서렬적동원성분석결과표명,Cry1Ab17단백여이보도적Cry1Ab단백동원성위95.4%~99.7%,해단백적4개안기산잔기--Pro170、Gly449、Gly796화Gly863여기타이보도Cry1Ab단백상응위치적안기산잔기균불동.재핵감산서렬화안기산서렬다중비교적기출상,응용PAUP 4.0구건료Cry1A단백가족적계통발육수.SignalP분석결과현시,Cry1Ab17단백중불함신호태서렬.차외,대Cry1Ab17단백적이급결구화3개결구역야진행료예측화분석.도4표2삼15