物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2004年
6期
569-572
,共4页
谢爱华%李伯玉%廖晨钟%李志斌%鲁先平%石乐明%周家驹
謝愛華%李伯玉%廖晨鐘%李誌斌%魯先平%石樂明%週傢駒
사애화%리백옥%료신종%리지빈%로선평%석악명%주가구
组蛋白去乙酰酶(HDAC),组蛋白去乙酰酶类似蛋白(HDLP),曲古柳菌素A(TSA),对接,MS-275
組蛋白去乙酰酶(HDAC),組蛋白去乙酰酶類似蛋白(HDLP),麯古柳菌素A(TSA),對接,MS-275
조단백거을선매(HDAC),조단백거을선매유사단백(HDLP),곡고류균소A(TSA),대접,MS-275
Histone deacetylase(HDAC)%Histone deacetylase like protein(HDLP)%Trichostatin A(TSA)%Docking%MS-275
通过计算机模拟的对接过程研究,发现了MS-275--一种苯甲酰胺类的组蛋白去乙酰酶(HDAC)抑制剂与酶的可能的全新结合方式.这种结合方式与已经阐明的组蛋白去乙酰酶类似蛋白(HDLP)与曲古柳菌素A(trichostatin A,TSA)和suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)形成的复合物晶体结构中配体与酶的作用方式完全不同.从对接结果看,MS-275的作用靶点在酶活性口袋的最狭窄部位,而不是直接作用于锌离子.这似乎能够解释MS-275的低毒性特点,并且为设计和筛选全新的HDAC抑制剂提供了新思路.
通過計算機模擬的對接過程研究,髮現瞭MS-275--一種苯甲酰胺類的組蛋白去乙酰酶(HDAC)抑製劑與酶的可能的全新結閤方式.這種結閤方式與已經闡明的組蛋白去乙酰酶類似蛋白(HDLP)與麯古柳菌素A(trichostatin A,TSA)和suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)形成的複閤物晶體結構中配體與酶的作用方式完全不同.從對接結果看,MS-275的作用靶點在酶活性口袋的最狹窄部位,而不是直接作用于鋅離子.這似乎能夠解釋MS-275的低毒性特點,併且為設計和篩選全新的HDAC抑製劑提供瞭新思路.
통과계산궤모의적대접과정연구,발현료MS-275--일충분갑선알류적조단백거을선매(HDAC)억제제여매적가능적전신결합방식.저충결합방식여이경천명적조단백거을선매유사단백(HDLP)여곡고류균소A(trichostatin A,TSA)화suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)형성적복합물정체결구중배체여매적작용방식완전불동.종대접결과간,MS-275적작용파점재매활성구대적최협착부위,이불시직접작용우자리자.저사호능구해석MS-275적저독성특점,병차위설계화사선전신적HDAC억제제제공료신사로.
The paper proposed a possible binding mode of MS-275, a benzamide histone deacetylase(HDAC) inhibitor, to HDAC by intensive docking study. This binding mode is different from those observed in the crystal structure of complexes formed by a histone deacetylase-like protein (HDLP) with trichostatin A(TSA) or suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA). The docking result implicates that the main target of MS-275 is the narrowest part of H-DAC active pocket. It seems to be able to explain the low toxicity of MS-275 and provides new insights on the design of novel HDAC inhibitors.
