CAJ | 학술논문

目的:进一步精细限定鼻咽癌9p21-22区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,筛选和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因.方法:应用11个定位于9p21-22区域的高密度微卫星位点,检测25例低分化鼻咽癌患者的杂合性丢失,确定其共同缺失区;用RT PCR和Northern筛出在鼻咽癌细胞株HNE1和鼻咽癌活检组织中表达下调的、定位于共同缺失区内的3'末端ESTs(ExpressSequenceTags);采用RACE技术和生物信息学资源克隆出候选EST的全长cDNA.结果:25例患者中有17例(68%)存在一个或多个位点的杂合性丢失,其中D9S161(35.0%,7/20),D9S1678(31.5%,6/19),D9S263(33.3%,6/18)和D9S1853(33.3%,7/21)四个紧邻位点的丢失频率相对较高,并发现六位患者在该四个位点表现为连续性缺失;筛选D9S161～D9S1853区域内25个代表新基因的3'末端ESTs序列,发现一个EST(dbEST:208825)在鼻咽癌细胞株HNE1及73%(11/15)的活检组织中表达降低,MultipleTissueNorthern(MTNTM)Blots杂交结果显示该EST在心、脑组织中存在大小约2.4kb和3.5kb的两个转录本.通过测定包含该EST的cDNA克隆,获得该新基因(命名为NAG 6基因)2.4kb转录本的全长cDNA(GenBank登录号:AF149298).结论:鼻咽癌染色体9p21-22区域D9S161 D9S1853位点之间(2.7cM)是鼻咽癌患者的一个较小共同缺失区,定位于该区域内的新基因NAG 6可能是一个与鼻咽癌相关的候选抑瘤基因.
목적:진일보정세한정비인암9p21-22구역등위기인잡합성주실적빈솔화범위,사선화극륭기공동결실구내비인암상관적후선억류기인.방법:응용11개정위우9p21-22구역적고밀도미위성위점,검측25례저분화비인암환자적잡합성주실,학정기공동결실구;용RT PCR화Northern사출재비인암세포주HNE1화비인암활검조직중표체하조적、정위우공동결실구내적3'말단ESTs(ExpressSequenceTags);채용RACE기술화생물신식학자원극륭출후선EST적전장cDNA.결과:25례환자중유17례(68%)존재일개혹다개위점적잡합성주실,기중D9S161(35.0%,7/20),D9S1678(31.5%,6/19),D9S263(33.3%,6/18)화D9S1853(33.3%,7/21)사개긴린위점적주실빈솔상대교고,병발현육위환자재해사개위점표현위련속성결실;사선D9S161～D9S1853구역내25개대표신기인적3'말단ESTs서렬,발현일개EST(dbEST:208825)재비인암세포주HNE1급73%(11/15)적활검조직중표체강저,MultipleTissueNorthern(MTNTM)Blots잡교결과현시해EST재심、뇌조직중존재대소약2.4kb화3.5kb적량개전록본.통과측정포함해EST적cDNA극륭,획득해신기인(명명위NAG 6기인)2.4kb전록본적전장cDNA(GenBank등록호:AF149298).결론:비인암염색체9p21-22구역D9S161 D9S1853위점지간(2.7cM)시비인암환자적일개교소공동결실구,정위우해구역내적신기인NAG 6가능시일개여비인암상관적후선억류기인.