遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2002年
4期
447-454
,共8页
肠道细菌%16S DNA序列%系统演化
腸道細菌%16S DNA序列%繫統縯化
장도세균%16S DNA서렬%계통연화
肠道微生物与寄主具有复杂的、多方面的相互依存效应,这种依存效应所产生的共生关系或协同进化关系既可反映寄主间的系统演化关系,也可显示肠道微生物间的系统演化关系,共生关系或协同进化关系是由于寄主与肠道微生物两者之间存在着相互自然选择作用所形成的,在长期的进化历程中逐步发生的共生关系信息很可能被记录在DNA序列中.本文通过检测鲤鱼科8种鱼中9种肠道菌群的分布含量对这9种菌群进行分析,且利用从GenBank调取这9种肠道细菌菌属的43个种或亚种的16S DNA序列的构建NJ树和MP树,将这6个科9个属43个种或亚种分为革兰氏阴性和革兰氏阳性两大类群(一级分枝).在这两类群中,又以科为单位分为6个亚类群(二级分枝),而肠杆菌科中则以属为单位分为4个小类群(三级分枝),此外球状菌与杆状菌也能截然分开.将16S DNA的NJ树隐去所有的种,以属为单位所得到的以分枝形式的无根树在拓扑结构上与菌群分布含量(寄主范围)所构建的无根树相近,但芽孢杆菌在两种无根树的位置中有较大的差异.如果提高检测水平,扩大所检测的寄主对象,这种差异有可能消除.
腸道微生物與寄主具有複雜的、多方麵的相互依存效應,這種依存效應所產生的共生關繫或協同進化關繫既可反映寄主間的繫統縯化關繫,也可顯示腸道微生物間的繫統縯化關繫,共生關繫或協同進化關繫是由于寄主與腸道微生物兩者之間存在著相互自然選擇作用所形成的,在長期的進化歷程中逐步髮生的共生關繫信息很可能被記錄在DNA序列中.本文通過檢測鯉魚科8種魚中9種腸道菌群的分佈含量對這9種菌群進行分析,且利用從GenBank調取這9種腸道細菌菌屬的43箇種或亞種的16S DNA序列的構建NJ樹和MP樹,將這6箇科9箇屬43箇種或亞種分為革蘭氏陰性和革蘭氏暘性兩大類群(一級分枝).在這兩類群中,又以科為單位分為6箇亞類群(二級分枝),而腸桿菌科中則以屬為單位分為4箇小類群(三級分枝),此外毬狀菌與桿狀菌也能截然分開.將16S DNA的NJ樹隱去所有的種,以屬為單位所得到的以分枝形式的無根樹在拓撲結構上與菌群分佈含量(寄主範圍)所構建的無根樹相近,但芽孢桿菌在兩種無根樹的位置中有較大的差異.如果提高檢測水平,擴大所檢測的寄主對象,這種差異有可能消除.
장도미생물여기주구유복잡적、다방면적상호의존효응,저충의존효응소산생적공생관계혹협동진화관계기가반영기주간적계통연화관계,야가현시장도미생물간적계통연화관계,공생관계혹협동진화관계시유우기주여장도미생물량자지간존재착상호자연선택작용소형성적,재장기적진화역정중축보발생적공생관계신식흔가능피기록재DNA서렬중.본문통과검측리어과8충어중9충장도균군적분포함량대저9충균군진행분석,차이용종GenBank조취저9충장도세균균속적43개충혹아충적16S DNA서렬적구건NJ수화MP수,장저6개과9개속43개충혹아충분위혁란씨음성화혁란씨양성량대류군(일급분지).재저량류군중,우이과위단위분위6개아류군(이급분지),이장간균과중칙이속위단위분위4개소류군(삼급분지),차외구상균여간상균야능절연분개.장16S DNA적NJ수은거소유적충,이속위단위소득도적이분지형식적무근수재탁복결구상여균군분포함량(기주범위)소구건적무근수상근,단아포간균재량충무근수적위치중유교대적차이.여과제고검측수평,확대소검측적기주대상,저충차이유가능소제.
