中国现代医学杂志
中國現代醫學雜誌
중국현대의학잡지
CHINA JOURNAL OF MODERN MEDICINE
2008年
10期
1346-1349
,共4页
张薇%霍建民%李殿俊%石玉枝
張薇%霍建民%李殿俊%石玉枝
장미%곽건민%리전준%석옥지
肺腺癌%基因表达%转移%KEGG数据库
肺腺癌%基因錶達%轉移%KEGG數據庫
폐선암%기인표체%전이%KEGG수거고
目的 利用基因芯片技术研究肺腺癌、转移淋巴结、癌旁正常及胚胎肺组织中的基因表达差异,并利用代谢通路数据库分析这些基因与代谢通路相关性信息.方法 分别抽取肺腺癌、转移淋巴结、癌旁正常和胚胎肺组织的总PNA并纯化nRNA,用逆转录的方法,将各mRNA的两种荧光Cy5和Cy3标记的cDNA链做探针,并与含有1152条人类全长基因芯片上进行杂交.用计算机处理和分析.将实验所得基因映射到(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路数据库的基因表达调控通路上,检测同一基因表达调控通路内基因的共表达趋势.结果 4例肺腺癌组织和癌旁正常组织比较共表达差异基因25个;3例肺腺癌组织和转移淋巴结组织比较共表达差异基因8个;1例胚胎肺组织和癌旁正常组织比较差异表达基因316个,且与肺腺癌组织和癌旁正常组织比较16个基因有共同表达差异.在β-丙氨酸代谢通路和丁酸代谢通路中的基因与疾痛组织中的基因显著相关(P<0.05),而与癌旁组织和淋巴结组织中的基因无关(P>0.05).结论 肺腺癌组织与癌旁正常组织比较、肺腺癌组织和转移淋巴结组织比较均存在共表达差异基因,这些基因可能与肺腺癌的发生、发展有关.代谢通路分析结果提示,在β-丙氨酸代谢通路和丁酸代谢通路中存在着肺腺癌疾病相关的基因,且在同一通路中的基因有共表达趋势.
目的 利用基因芯片技術研究肺腺癌、轉移淋巴結、癌徬正常及胚胎肺組織中的基因錶達差異,併利用代謝通路數據庫分析這些基因與代謝通路相關性信息.方法 分彆抽取肺腺癌、轉移淋巴結、癌徬正常和胚胎肺組織的總PNA併純化nRNA,用逆轉錄的方法,將各mRNA的兩種熒光Cy5和Cy3標記的cDNA鏈做探針,併與含有1152條人類全長基因芯片上進行雜交.用計算機處理和分析.將實驗所得基因映射到(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路數據庫的基因錶達調控通路上,檢測同一基因錶達調控通路內基因的共錶達趨勢.結果 4例肺腺癌組織和癌徬正常組織比較共錶達差異基因25箇;3例肺腺癌組織和轉移淋巴結組織比較共錶達差異基因8箇;1例胚胎肺組織和癌徬正常組織比較差異錶達基因316箇,且與肺腺癌組織和癌徬正常組織比較16箇基因有共同錶達差異.在β-丙氨痠代謝通路和丁痠代謝通路中的基因與疾痛組織中的基因顯著相關(P<0.05),而與癌徬組織和淋巴結組織中的基因無關(P>0.05).結論 肺腺癌組織與癌徬正常組織比較、肺腺癌組織和轉移淋巴結組織比較均存在共錶達差異基因,這些基因可能與肺腺癌的髮生、髮展有關.代謝通路分析結果提示,在β-丙氨痠代謝通路和丁痠代謝通路中存在著肺腺癌疾病相關的基因,且在同一通路中的基因有共錶達趨勢.
목적 이용기인심편기술연구폐선암、전이림파결、암방정상급배태폐조직중적기인표체차이,병이용대사통로수거고분석저사기인여대사통로상관성신식.방법 분별추취폐선암、전이림파결、암방정상화배태폐조직적총PNA병순화nRNA,용역전록적방법,장각mRNA적량충형광Cy5화Cy3표기적cDNA련주탐침,병여함유1152조인류전장기인심편상진행잡교.용계산궤처리화분석.장실험소득기인영사도(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)통로수거고적기인표체조공통로상,검측동일기인표체조공통로내기인적공표체추세.결과 4례폐선암조직화암방정상조직비교공표체차이기인25개;3례폐선암조직화전이림파결조직비교공표체차이기인8개;1례배태폐조직화암방정상조직비교차이표체기인316개,차여폐선암조직화암방정상조직비교16개기인유공동표체차이.재β-병안산대사통로화정산대사통로중적기인여질통조직중적기인현저상관(P<0.05),이여암방조직화림파결조직중적기인무관(P>0.05).결론 폐선암조직여암방정상조직비교、폐선암조직화전이림파결조직비교균존재공표체차이기인,저사기인가능여폐선암적발생、발전유관.대사통로분석결과제시,재β-병안산대사통로화정산대사통로중존재착폐선암질병상관적기인,차재동일통로중적기인유공표체추세.
