中山大学学报（自然科学版）
中山大學學報（自然科學版）
중산대학학보（자연과학판）
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2008年
5期
74-80
,共7页
水龙骨科%核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶%rbcL基因%正向选择位点
水龍骨科%覈酮糖-1,5-二燐痠羧化酶/加氧酶%rbcL基因%正嚮選擇位點
수용골과%핵동당-1,5-이린산최화매/가양매%rbcL기인%정향선택위점
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco,EC 4.1.1.39)在植物光合作用中起重要作用,既负责碳同化又引发光呼吸.催化固定CO2的活性位点位于Rubisco大亚基,由叶绿体rbcL基因编码.水龙骨科是现存蕨类中最为衍生的类群,多为附生植物.为验证蕨类植物在白垩纪适应被子植物兴起而发生分化的观点,本研究以水龙骨科附生蕨类为对象,利用位点间可变ω(非同义替换率dN和同义替换率dS的比值)模型对其rbcL基因的适应性进化进行分析.通过比较模型M1a/M2a 和模型M7/M8,在氨基酸水平上,共鉴定出7个正向选择位点:133L,251M,262A,265V,282Y,326I和362I.其中位点262A,265V,282Y及326I对维持Rubisco功能的重要性也得到已发表实验数据的支持.这些结果一方面显示了基于ω比值检验DNA编码序列分子适应的有效性,另一方面也提示水龙骨类可借助rbcL等功能基因的适应性进化,应对白垩纪被子植物引发的陆地生态系统改变.
覈酮糖-1,5-二燐痠羧化酶/加氧酶(Rubisco,EC 4.1.1.39)在植物光閤作用中起重要作用,既負責碳同化又引髮光呼吸.催化固定CO2的活性位點位于Rubisco大亞基,由葉綠體rbcL基因編碼.水龍骨科是現存蕨類中最為衍生的類群,多為附生植物.為驗證蕨類植物在白堊紀適應被子植物興起而髮生分化的觀點,本研究以水龍骨科附生蕨類為對象,利用位點間可變ω(非同義替換率dN和同義替換率dS的比值)模型對其rbcL基因的適應性進化進行分析.通過比較模型M1a/M2a 和模型M7/M8,在氨基痠水平上,共鑒定齣7箇正嚮選擇位點:133L,251M,262A,265V,282Y,326I和362I.其中位點262A,265V,282Y及326I對維持Rubisco功能的重要性也得到已髮錶實驗數據的支持.這些結果一方麵顯示瞭基于ω比值檢驗DNA編碼序列分子適應的有效性,另一方麵也提示水龍骨類可藉助rbcL等功能基因的適應性進化,應對白堊紀被子植物引髮的陸地生態繫統改變.
핵동당-1,5-이린산최화매/가양매(Rubisco,EC 4.1.1.39)재식물광합작용중기중요작용,기부책탄동화우인발광호흡.최화고정CO2적활성위점위우Rubisco대아기,유협록체rbcL기인편마.수용골과시현존궐류중최위연생적류군,다위부생식물.위험증궐류식물재백성기괄응피자식물흥기이발생분화적관점,본연구이수용골과부생궐류위대상,이용위점간가변ω(비동의체환솔dN화동의체환솔dS적비치)모형대기rbcL기인적괄응성진화진행분석.통과비교모형M1a/M2a 화모형M7/M8,재안기산수평상,공감정출7개정향선택위점:133L,251M,262A,265V,282Y,326I화362I.기중위점262A,265V,282Y급326I대유지Rubisco공능적중요성야득도이발표실험수거적지지.저사결과일방면현시료기우ω비치검험DNA편마서렬분자괄응적유효성,령일방면야제시수용골류가차조rbcL등공능기인적괄응성진화,응대백성기피자식물인발적륙지생태계통개변.
