草业学报
草業學報
초업학보
PRATACULTURAL SCIENCE
2011年
3期
211-218
,共8页
江腾%林勇祥%刘雪%江海洋%朱苏文
江騰%林勇祥%劉雪%江海洋%硃囌文
강등%림용상%류설%강해양%주소문
苜蓿%WRKY%系统发生树%生物信息学
苜蓿%WRKY%繫統髮生樹%生物信息學
목숙%WRKY%계통발생수%생물신식학
蒺藜苜蓿的基因组较小,遗传转化相对容易,是国际上广泛用于研究豆科植物的模式植物,其全基因组测序已经完成.WRKY转录因子是近年来在植物中发现的N-端含有WRKYGQK高度保守氨基酸序列的新型转录调控因子,调节启动子中含W-box元件的调节基因和(/或)功能基因的表达,从而参与植物的各种防卫反应.本研究以苜蓿基因组序列(Mt2.0)为材料,利用生物信息学方法分析苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的数目、种类、系统发生学、保守基序,结果表明,苜蓿中共有28个WRKY基因,其中5个基因含有2个WRKY结构域,共含有33个WRKY结构域,根据其结构域特点可以分为3个大类,同时与水稻WRKY基因进行了比较研究,发现基因数目远少于拟南芥和水稻,同时研究证实苜蓿与水稻WRKY基因的起源和进化关系存在较大差异,显示出苜蓿WRKY进化有其独特的特点,此外分析苜蓿WRKY基因的保守motif共有46个,筛选得到WRKY结构域的5个保守motif.该研究对苜蓿WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义.
蒺藜苜蓿的基因組較小,遺傳轉化相對容易,是國際上廣汎用于研究豆科植物的模式植物,其全基因組測序已經完成.WRKY轉錄因子是近年來在植物中髮現的N-耑含有WRKYGQK高度保守氨基痠序列的新型轉錄調控因子,調節啟動子中含W-box元件的調節基因和(/或)功能基因的錶達,從而參與植物的各種防衛反應.本研究以苜蓿基因組序列(Mt2.0)為材料,利用生物信息學方法分析苜蓿全基因組WRKY轉錄因子基因的數目、種類、繫統髮生學、保守基序,結果錶明,苜蓿中共有28箇WRKY基因,其中5箇基因含有2箇WRKY結構域,共含有33箇WRKY結構域,根據其結構域特點可以分為3箇大類,同時與水稻WRKY基因進行瞭比較研究,髮現基因數目遠少于擬南芥和水稻,同時研究證實苜蓿與水稻WRKY基因的起源和進化關繫存在較大差異,顯示齣苜蓿WRKY進化有其獨特的特點,此外分析苜蓿WRKY基因的保守motif共有46箇,篩選得到WRKY結構域的5箇保守motif.該研究對苜蓿WRKY基因功能的研究及進化具有重要的意義.
질려목숙적기인조교소,유전전화상대용역,시국제상엄범용우연구두과식물적모식식물,기전기인조측서이경완성.WRKY전록인자시근년래재식물중발현적N-단함유WRKYGQK고도보수안기산서렬적신형전록조공인자,조절계동자중함W-box원건적조절기인화(/혹)공능기인적표체,종이삼여식물적각충방위반응.본연구이목숙기인조서렬(Mt2.0)위재료,이용생물신식학방법분석목숙전기인조WRKY전록인자기인적수목、충류、계통발생학、보수기서,결과표명,목숙중공유28개WRKY기인,기중5개기인함유2개WRKY결구역,공함유33개WRKY결구역,근거기결구역특점가이분위3개대류,동시여수도WRKY기인진행료비교연구,발현기인수목원소우의남개화수도,동시연구증실목숙여수도WRKY기인적기원화진화관계존재교대차이,현시출목숙WRKY진화유기독특적특점,차외분석목숙WRKY기인적보수motif공유46개,사선득도WRKY결구역적5개보수motif.해연구대목숙WRKY기인공능적연구급진화구유중요적의의.
