中国畜牧兽医
中國畜牧獸醫
중국축목수의
CHINA ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2012年
3期
51-54
,共4页
周飞%崔连成%安玉甫%宁章勇
週飛%崔連成%安玉甫%寧章勇
주비%최련성%안옥보%저장용
唾液酸转移酶%流感受体%鸡%半定量%生物信息学
唾液痠轉移酶%流感受體%鷄%半定量%生物信息學
타액산전이매%류감수체%계%반정량%생물신식학
本研究旨在对三黄鸡ST3Gal6基因进行组织表达谱和生物信息学分析.参考三黄鸡ST3Gal6基因序列设计引物,采用PCR技术克隆三黄鸡ST3Gal6基因序列,并利用半定量RT PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析.结果表明,克隆的三黄鸡ST3Gal6基因全长1169 bp,含有1059 bp的完整CDS编码区,编码352个氨基酸.其CDS编码区的核苷酸序列与人、黑猩猩、牛、大鼠、蟾ST3Gal6基因对应序列的同源性分别为62%、62%、61.9%、59%、54.4%.组织表达谱分析表明,ST3Gal6基因在各组织均不同程度地表达,其中在大脑表达量很高,肺脏中最低.生物信息学预测ST3Gal6蛋白结构发现,三黄鸡的ST3Gal6蛋白存在2个跨膜螺旋结构域,同时预测ST3Gal6存在22个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点.
本研究旨在對三黃鷄ST3Gal6基因進行組織錶達譜和生物信息學分析.參攷三黃鷄ST3Gal6基因序列設計引物,採用PCR技術剋隆三黃鷄ST3Gal6基因序列,併利用半定量RT PCR進行組織錶達譜分析;同時對其進行生物信息學分析.結果錶明,剋隆的三黃鷄ST3Gal6基因全長1169 bp,含有1059 bp的完整CDS編碼區,編碼352箇氨基痠.其CDS編碼區的覈苷痠序列與人、黑猩猩、牛、大鼠、蟾ST3Gal6基因對應序列的同源性分彆為62%、62%、61.9%、59%、54.4%.組織錶達譜分析錶明,ST3Gal6基因在各組織均不同程度地錶達,其中在大腦錶達量很高,肺髒中最低.生物信息學預測ST3Gal6蛋白結構髮現,三黃鷄的ST3Gal6蛋白存在2箇跨膜螺鏇結構域,同時預測ST3Gal6存在22箇燐痠化位點和1箇特異性蛋白激酶燐痠化位點.
본연구지재대삼황계ST3Gal6기인진행조직표체보화생물신식학분석.삼고삼황계ST3Gal6기인서렬설계인물,채용PCR기술극륭삼황계ST3Gal6기인서렬,병이용반정량RT PCR진행조직표체보분석;동시대기진행생물신식학분석.결과표명,극륭적삼황계ST3Gal6기인전장1169 bp,함유1059 bp적완정CDS편마구,편마352개안기산.기CDS편마구적핵감산서렬여인、흑성성、우、대서、섬ST3Gal6기인대응서렬적동원성분별위62%、62%、61.9%、59%、54.4%.조직표체보분석표명,ST3Gal6기인재각조직균불동정도지표체,기중재대뇌표체량흔고,폐장중최저.생물신식학예측ST3Gal6단백결구발현,삼황계적ST3Gal6단백존재2개과막라선결구역,동시예측ST3Gal6존재22개린산화위점화1개특이성단백격매린산화위점.