生物物理学报
生物物理學報
생물물이학보
ACTA BIOPHYSICA SINICA
2004年
4期
315-322
,共8页
王吉华%张志勇%刘海燕%施蕴渝
王吉華%張誌勇%劉海燕%施蘊渝
왕길화%장지용%류해연%시온투
分子动力学模拟%压强温度耦合%去折叠过程%GB1
分子動力學模擬%壓彊溫度耦閤%去摺疊過程%GB1
분자동역학모의%압강온도우합%거절첩과정%GB1
在不同温度(280~540K)和压强(1×102~8×105kPa)的耦合作用下,对GB1(the B1 domain ofprotein G)进行了56次独立分子动力学模拟,模拟时间达88.8 ns.在此基础上,研究了压强和温度对GB1去折叠过程的耦合效应.结果表明,压强对温度去折叠过程有明显影响,改变了蛋白质二级结构去折叠速度和蛋白质去折叠过程发生事件的先后次序.相同温度下,GB1的α-螺旋和β-折叠的稳定性随压强增大而提高;可及性表面积和其它结构特性参数随压强增大而减小.适度的压强(如2×105kPa)会抑制温度导致的GB1二级结构去折叠速度,而更大的压强(如8×105 kPa)又加速了GB1的去折叠速度.在模拟的温度范围,当压强为100和2×105kPa时,GB1疏水核协同暴露于水,而5×105和8×105 kPa时没出现此现象,这与最近的高压变性实验结果一致.
在不同溫度(280~540K)和壓彊(1×102~8×105kPa)的耦閤作用下,對GB1(the B1 domain ofprotein G)進行瞭56次獨立分子動力學模擬,模擬時間達88.8 ns.在此基礎上,研究瞭壓彊和溫度對GB1去摺疊過程的耦閤效應.結果錶明,壓彊對溫度去摺疊過程有明顯影響,改變瞭蛋白質二級結構去摺疊速度和蛋白質去摺疊過程髮生事件的先後次序.相同溫度下,GB1的α-螺鏇和β-摺疊的穩定性隨壓彊增大而提高;可及性錶麵積和其它結構特性參數隨壓彊增大而減小.適度的壓彊(如2×105kPa)會抑製溫度導緻的GB1二級結構去摺疊速度,而更大的壓彊(如8×105 kPa)又加速瞭GB1的去摺疊速度.在模擬的溫度範圍,噹壓彊為100和2×105kPa時,GB1疏水覈協同暴露于水,而5×105和8×105 kPa時沒齣現此現象,這與最近的高壓變性實驗結果一緻.
재불동온도(280~540K)화압강(1×102~8×105kPa)적우합작용하,대GB1(the B1 domain ofprotein G)진행료56차독립분자동역학모의,모의시간체88.8 ns.재차기출상,연구료압강화온도대GB1거절첩과정적우합효응.결과표명,압강대온도거절첩과정유명현영향,개변료단백질이급결구거절첩속도화단백질거절첩과정발생사건적선후차서.상동온도하,GB1적α-라선화β-절첩적은정성수압강증대이제고;가급성표면적화기타결구특성삼수수압강증대이감소.괄도적압강(여2×105kPa)회억제온도도치적GB1이급결구거절첩속도,이경대적압강(여8×105 kPa)우가속료GB1적거절첩속도.재모의적온도범위,당압강위100화2×105kPa시,GB1소수핵협동폭로우수,이5×105화8×105 kPa시몰출현차현상,저여최근적고압변성실험결과일치.