遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2010年
5期
473-479
,共7页
曾健强%徐筠娉%王大明%高素青%邹红岩%邓志辉
曾健彊%徐筠娉%王大明%高素青%鄒紅巖%鄧誌輝
증건강%서균빙%왕대명%고소청%추홍암%산지휘
人类白细胞抗原%HLA-Cw基因%基因组全长序列%克隆和测序分析%单核苷酸多态性
人類白細胞抗原%HLA-Cw基因%基因組全長序列%剋隆和測序分析%單覈苷痠多態性
인류백세포항원%HLA-Cw기인%기인조전장서렬%극륭화측서분석%단핵감산다태성
为探讨HLA-Cw (Human leukocyte antigen-Cw)基因全长序列分子遗传多态性,文章对28个HLA-Cw基因型已知的汉族个体样本,采用长距离PCR技术和高保真性的Pfu酶,扩增HLA-Cw基因全长序列4.5 kb,进行分子克隆和单倍体测序.采用群体遗传学研究方法分析了HLA-Cw等位基因全长序列中各亚区的单核苷酸多态性.结果表明:在28个样本中共检测出22种等位基因,序列均已提交GenBank和国际IMGT/HLA数据库并获得了认可;其中Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201的全长序列为首次报道,尤其是Cw*0706内含子序列的获得,能够重新设计对该等位基因测序分型的引物,避免测序分型中可能对这一等位基因的漏检.将28个样本的56条单倍体序列用Clustal软件进行序列排比,输入到DnaSP4.0进行多态性分析,共发现244个SNPs,10处插入/缺失多态性.对HLA-Cw等位基因各亚区多态性的分析,发现第4内含子及以前并没有受到关注的第5外显子受到平衡选择的作用,在进化中受到了选择压力,预示着它们在免疫系统的进化过程中可能扮演着重要的角色.
為探討HLA-Cw (Human leukocyte antigen-Cw)基因全長序列分子遺傳多態性,文章對28箇HLA-Cw基因型已知的漢族箇體樣本,採用長距離PCR技術和高保真性的Pfu酶,擴增HLA-Cw基因全長序列4.5 kb,進行分子剋隆和單倍體測序.採用群體遺傳學研究方法分析瞭HLA-Cw等位基因全長序列中各亞區的單覈苷痠多態性.結果錶明:在28箇樣本中共檢測齣22種等位基因,序列均已提交GenBank和國際IMGT/HLA數據庫併穫得瞭認可;其中Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201的全長序列為首次報道,尤其是Cw*0706內含子序列的穫得,能夠重新設計對該等位基因測序分型的引物,避免測序分型中可能對這一等位基因的漏檢.將28箇樣本的56條單倍體序列用Clustal軟件進行序列排比,輸入到DnaSP4.0進行多態性分析,共髮現244箇SNPs,10處插入/缺失多態性.對HLA-Cw等位基因各亞區多態性的分析,髮現第4內含子及以前併沒有受到關註的第5外顯子受到平衡選擇的作用,在進化中受到瞭選擇壓力,預示著它們在免疫繫統的進化過程中可能扮縯著重要的角色.
위탐토HLA-Cw (Human leukocyte antigen-Cw)기인전장서렬분자유전다태성,문장대28개HLA-Cw기인형이지적한족개체양본,채용장거리PCR기술화고보진성적Pfu매,확증HLA-Cw기인전장서렬4.5 kb,진행분자극륭화단배체측서.채용군체유전학연구방법분석료HLA-Cw등위기인전장서렬중각아구적단핵감산다태성.결과표명:재28개양본중공검측출22충등위기인,서렬균이제교GenBank화국제IMGT/HLA수거고병획득료인가;기중Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201적전장서렬위수차보도,우기시Cw*0706내함자서렬적획득,능구중신설계대해등위기인측서분형적인물,피면측서분형중가능대저일등위기인적루검.장28개양본적56조단배체서렬용Clustal연건진행서렬배비,수입도DnaSP4.0진행다태성분석,공발현244개SNPs,10처삽입/결실다태성.대HLA-Cw등위기인각아구다태성적분석,발현제4내함자급이전병몰유수도관주적제5외현자수도평형선택적작용,재진화중수도료선택압력,예시착타문재면역계통적진화과정중가능분연착중요적각색.
