蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2005年
1期
53-58
,共6页
孙京臣%杨艺峰%戴伟君%谭玉蓉%张勤奋%张景强%徐兴耀
孫京臣%楊藝峰%戴偉君%譚玉蓉%張勤奮%張景彊%徐興耀
손경신%양예봉%대위군%담옥용%장근강%장경강%서흥요
家蚕质型多角体病毒%dsRNA%RDRP基因%同源性
傢蠶質型多角體病毒%dsRNA%RDRP基因%同源性
가잠질형다각체병독%dsRNA%RDRP기인%동원성
应用分段RT-PCR方法和分子克隆技术从家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)中国株的dsRNA中成功地分3段克隆了RDRP基因(RNA-dependent RNA polymerase),大小分别为1 442、827、1 675 bp,进行了基因全序列拼接,获得3.7 kb的全长RDRP基因(GenBank序列号为:AY496445).通过在线blast分析,与BmCPV-1、DpCPV-1、LdCPV-1、LdCPV-14、TnCPV-15核苷酸同源性分别为89%、81%、81%、54.1%和50.9%,氨基酸同源性分别为96.5%、93.1%、92.9%、41.1%和33.5%.根据核苷酸同源性与氨基酸同源性构建的进化树具有较好的一致性.通过ClustalX软件分析,定位了该病毒RDRP基因的3个保守区域(酸性区,核苷酸结合的核心区和催化功能核心区).
應用分段RT-PCR方法和分子剋隆技術從傢蠶質型多角體病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)中國株的dsRNA中成功地分3段剋隆瞭RDRP基因(RNA-dependent RNA polymerase),大小分彆為1 442、827、1 675 bp,進行瞭基因全序列拼接,穫得3.7 kb的全長RDRP基因(GenBank序列號為:AY496445).通過在線blast分析,與BmCPV-1、DpCPV-1、LdCPV-1、LdCPV-14、TnCPV-15覈苷痠同源性分彆為89%、81%、81%、54.1%和50.9%,氨基痠同源性分彆為96.5%、93.1%、92.9%、41.1%和33.5%.根據覈苷痠同源性與氨基痠同源性構建的進化樹具有較好的一緻性.通過ClustalX軟件分析,定位瞭該病毒RDRP基因的3箇保守區域(痠性區,覈苷痠結閤的覈心區和催化功能覈心區).
응용분단RT-PCR방법화분자극륭기술종가잠질형다각체병독(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)중국주적dsRNA중성공지분3단극륭료RDRP기인(RNA-dependent RNA polymerase),대소분별위1 442、827、1 675 bp,진행료기인전서렬병접,획득3.7 kb적전장RDRP기인(GenBank서렬호위:AY496445).통과재선blast분석,여BmCPV-1、DpCPV-1、LdCPV-1、LdCPV-14、TnCPV-15핵감산동원성분별위89%、81%、81%、54.1%화50.9%,안기산동원성분별위96.5%、93.1%、92.9%、41.1%화33.5%.근거핵감산동원성여안기산동원성구건적진화수구유교호적일치성.통과ClustalX연건분석,정위료해병독RDRP기인적3개보수구역(산성구,핵감산결합적핵심구화최화공능핵심구).