CAJ | 학술논문

利用已构建的仿刺参cDNA文库得到的线粒体DNA(mtDNA)相关基因序列设计扩增引物,测定了大连仿刺参线粒体基因组全序列,并对其进行了基因构成和进化分析.仿刺参线粒体基因组序列长16 109 bp,其基因构成与其他后口动物基本一致,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和3个主要的非编码区.在其37个基因中,ND6、tRNAScr(AGN)、tRNAGln、tRNAAla、tRNAVal、TrnaAsp位于L链上,其余均位于H链上.在13个蛋白质编码基因中,除ND1的起始密码子为GTG外,其余均以ATG作为起始密码子；除Cytb以“T”作为终止密码子外,其他蛋白质基因均具有完全的终止密码子,且在已知的棘皮动物线粒体蛋白质基因中,部分基因的起始和终止密码子表现出一定的纲内特异性.比较分析了大连、青岛、威海仿刺参线粒体基因组,三者的基因组成和排列相同,碱基组成相近,蛋白质编码基因的起始和终止密码子完全一致,但存在核苷酸和氨基酸序列的差异.三者的控制区序列存在多个插入/缺失和SNP位点.根据COI、Cytb和ND4计算了三者之间的遗传距离为0.006～0.018,遗传距离分析和系统进化关系分析都显示青岛仿刺参和威海仿刺参的关系较大连仿刺参更近.
이용이구건적방자삼cDNA문고득도적선립체DNA(mtDNA)상관기인서렬설계확증인물,측정료대련방자삼선립체기인조전서렬,병대기진행료기인구성화진화분석.방자삼선립체기인조서렬장16 109 bp,기기인구성여기타후구동물기본일치,포괄37개기인(2개rRNA기인、22개tRNA기인화13개단백질편마기인)화3개주요적비편마구.재기37개기인중,ND6、tRNAScr(AGN)、tRNAGln、tRNAAla、tRNAVal、TrnaAsp위우L련상,기여균위우H련상.재13개단백질편마기인중,제ND1적기시밀마자위GTG외,기여균이ATG작위기시밀마자；제Cytb이“T”작위종지밀마자외,기타단백질기인균구유완전적종지밀마자,차재이지적극피동물선립체단백질기인중,부분기인적기시화종지밀마자표현출일정적강내특이성.비교분석료대련、청도、위해방자삼선립체기인조,삼자적기인조성화배렬상동,감기조성상근,단백질편마기인적기시화종지밀마자완전일치,단존재핵감산화안기산서렬적차이.삼자적공제구서렬존재다개삽입/결실화SNP위점.근거COI、Cytb화ND4계산료삼자지간적유전거리위0.006～0.018,유전거리분석화계통진화관계분석도현시청도방자삼화위해방자삼적관계교대련방자삼경근.