热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2010年
8期
1266-1271
,共6页
关夏玉%张永嵘%黄天培%关雄
關夏玉%張永嶸%黃天培%關雄
관하옥%장영영%황천배%관웅
苏云金芽胞杆菌%cry1Ib2基因%克隆%生物信息学
囌雲金芽胞桿菌%cry1Ib2基因%剋隆%生物信息學
소운금아포간균%cry1Ib2기인%극륭%생물신식학
BRC-ZLL4是一株从鱼尾葵(Cargota mitis Lour)上分离到的,对柑橘凤蝶幼虫具有毒性的苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)菌株.本试验采用PCR-RFLP技术鉴定该菌株中含有cry1Ib基因.设计一对特异引物,分别引入Sal Ⅰ和BamH Ⅰ酶切位点.以BRC-ZLIA的总DNA为模板,扩增cry1Ib全长基因.生物信息学分析表明,该基因全长2 160 bp,编码一个由719个氨基酸组成的、相对分子质量为81.39 ku、等电点为6.425的蛋白.该基因已在GenBank上登录(登录号为EU233027),并被Bt δ-内毒素国际命名委员会正式命名为cry1Ib2.信号肽预测显示,Cry1Ib2蛋白没有信号肽,为胞内蛋白.二级结构预测显示,在Cry1Ib2蛋白二级结构中,25%为α-螺旋,28%为β-片层,18%为β-转角,29%为无规则线圈.此外还对Cry1Ib蛋白的功能区和三级结构进行了预测和分析.
BRC-ZLL4是一株從魚尾葵(Cargota mitis Lour)上分離到的,對柑橘鳳蝶幼蟲具有毒性的囌雲金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis)菌株.本試驗採用PCR-RFLP技術鑒定該菌株中含有cry1Ib基因.設計一對特異引物,分彆引入Sal Ⅰ和BamH Ⅰ酶切位點.以BRC-ZLIA的總DNA為模闆,擴增cry1Ib全長基因.生物信息學分析錶明,該基因全長2 160 bp,編碼一箇由719箇氨基痠組成的、相對分子質量為81.39 ku、等電點為6.425的蛋白.該基因已在GenBank上登錄(登錄號為EU233027),併被Bt δ-內毒素國際命名委員會正式命名為cry1Ib2.信號肽預測顯示,Cry1Ib2蛋白沒有信號肽,為胞內蛋白.二級結構預測顯示,在Cry1Ib2蛋白二級結構中,25%為α-螺鏇,28%為β-片層,18%為β-轉角,29%為無規則線圈.此外還對Cry1Ib蛋白的功能區和三級結構進行瞭預測和分析.
BRC-ZLL4시일주종어미규(Cargota mitis Lour)상분리도적,대감귤봉접유충구유독성적소운금아포간균(Bacillus thuringiensis)균주.본시험채용PCR-RFLP기술감정해균주중함유cry1Ib기인.설계일대특이인물,분별인입Sal Ⅰ화BamH Ⅰ매절위점.이BRC-ZLIA적총DNA위모판,확증cry1Ib전장기인.생물신식학분석표명,해기인전장2 160 bp,편마일개유719개안기산조성적、상대분자질량위81.39 ku、등전점위6.425적단백.해기인이재GenBank상등록(등록호위EU233027),병피Bt δ-내독소국제명명위원회정식명명위cry1Ib2.신호태예측현시,Cry1Ib2단백몰유신호태,위포내단백.이급결구예측현시,재Cry1Ib2단백이급결구중,25%위α-라선,28%위β-편층,18%위β-전각,29%위무규칙선권.차외환대Cry1Ib단백적공능구화삼급결구진행료예측화분석.