作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2011年
11期
1926-1934
,共9页
王旺田%张金文%王蒂%张俊莲%司怀军%陶士珩
王旺田%張金文%王蒂%張俊蓮%司懷軍%陶士珩
왕왕전%장금문%왕체%장준련%사부군%도사형
马铃薯%鼠李糖基转移酶%基因克隆%序列分析%RNAi载体
馬鈴藷%鼠李糖基轉移酶%基因剋隆%序列分析%RNAi載體
마령서%서리당기전이매%기인극륭%서렬분석%RNAi재체
为探讨鼠李糖基转移酶(rhamnosyltransferase,sgt3)基因与类固醇糖苷生物碱(steroidal glycoalkaloid,SGAs)合成关系,揭示sgt3基因在SGAs合成中的作用,本研究根据GenBank No:DQ266437保守区设计特异引物,通过RT-PCR技术获得马铃薯块茎sgt3相似基因;采用生物信息学相关软件分析,预测sgt3相似基因cDNA序列编码的蛋白质结构和功能,构建基于sgt3基因的植物干扰表达载体.结果表明,克隆的sgt3相似基因与报道的sgt3基因序列相似性达到99.54%,其ORF长为1 500 bp,编码505个氨基酸残基,具有UDPG糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;三级结构预测表明,该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似,为糖基转移酶家族成员,表明可能具有合成类固醇糖苷生物碱功能,基因序列已注册到GenBank,序列登录号为HM188447.以此为靶序列,构建由Actin启动子和CIPP启动子驱动的与sgtl和sgt2基因相似度高的含有sgt3基因序列的干扰表达载体,将为糖苷生物碱的合成、代谢的进一步研究及低糖苷生物碱转基因马铃薯品种的培育奠定基础.
為探討鼠李糖基轉移酶(rhamnosyltransferase,sgt3)基因與類固醇糖苷生物堿(steroidal glycoalkaloid,SGAs)閤成關繫,揭示sgt3基因在SGAs閤成中的作用,本研究根據GenBank No:DQ266437保守區設計特異引物,通過RT-PCR技術穫得馬鈴藷塊莖sgt3相似基因;採用生物信息學相關軟件分析,預測sgt3相似基因cDNA序列編碼的蛋白質結構和功能,構建基于sgt3基因的植物榦擾錶達載體.結果錶明,剋隆的sgt3相似基因與報道的sgt3基因序列相似性達到99.54%,其ORF長為1 500 bp,編碼505箇氨基痠殘基,具有UDPG糖基轉移酶保守結構域及許多重要功能位點;三級結構預測錶明,該氨基痠同糖基轉移酶單體結構模型相似,為糖基轉移酶傢族成員,錶明可能具有閤成類固醇糖苷生物堿功能,基因序列已註冊到GenBank,序列登錄號為HM188447.以此為靶序列,構建由Actin啟動子和CIPP啟動子驅動的與sgtl和sgt2基因相似度高的含有sgt3基因序列的榦擾錶達載體,將為糖苷生物堿的閤成、代謝的進一步研究及低糖苷生物堿轉基因馬鈴藷品種的培育奠定基礎.
위탐토서리당기전이매(rhamnosyltransferase,sgt3)기인여류고순당감생물감(steroidal glycoalkaloid,SGAs)합성관계,게시sgt3기인재SGAs합성중적작용,본연구근거GenBank No:DQ266437보수구설계특이인물,통과RT-PCR기술획득마령서괴경sgt3상사기인;채용생물신식학상관연건분석,예측sgt3상사기인cDNA서렬편마적단백질결구화공능,구건기우sgt3기인적식물간우표체재체.결과표명,극륭적sgt3상사기인여보도적sgt3기인서렬상사성체도99.54%,기ORF장위1 500 bp,편마505개안기산잔기,구유UDPG당기전이매보수결구역급허다중요공능위점;삼급결구예측표명,해안기산동당기전이매단체결구모형상사,위당기전이매가족성원,표명가능구유합성류고순당감생물감공능,기인서렬이주책도GenBank,서렬등록호위HM188447.이차위파서렬,구건유Actin계동자화CIPP계동자구동적여sgtl화sgt2기인상사도고적함유sgt3기인서렬적간우표체재체,장위당감생물감적합성、대사적진일보연구급저당감생물감전기인마령서품충적배육전정기출.