重庆医科大学学报
重慶醫科大學學報
중경의과대학학보
UNIVERSITATIS SCIENTIAE MEDICINAE CHONGQING
2011年
10期
1233-1236
,共4页
邹波%季平%孙守娟%漆小娟
鄒波%季平%孫守娟%漆小娟
추파%계평%손수연%칠소연
肿瘤干细胞%舌鳞癌%表达序列标签%生物信息学分析
腫瘤榦細胞%舌鱗癌%錶達序列標籤%生物信息學分析
종류간세포%설린암%표체서렬표첨%생물신식학분석
目的:对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressed squence tag,EST)进行电子克隆及序列分析.方法:利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索克隆差异表达基因的研究方法和策略.结果:通过电子延伸得到1个1 705 bp的cDNA序列；核酸序列分析显示,该cDNA定位在1号染色体,含有1个编码146个氨基酸的完整开放阅读框；对氨基酸序列进行结构域预测显示其存在1个与Translin超家族同源的区域；BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关蛋白X(Translin associated protein X,TRAX)具有较高的同源性.结论:利用生物信息学技术获得了舌鳞癌相关表达序列标签的基本信息,为深入研究该表达序列标签的功能奠定基础.
目的:對利用抑製消減雜交技術穫得的舌鱗癌榦細胞相關錶達序列標籤(Expressed squence tag,EST)進行電子剋隆及序列分析.方法:利用互聯網上的公共數據庫及生物信息學分析軟件對穫得的舌鱗癌榦細胞相關差異錶達序列標籤進行覈痠序列和蛋白質序列分析,探索剋隆差異錶達基因的研究方法和策略.結果:通過電子延伸得到1箇1 705 bp的cDNA序列；覈痠序列分析顯示,該cDNA定位在1號染色體,含有1箇編碼146箇氨基痠的完整開放閱讀框；對氨基痠序列進行結構域預測顯示其存在1箇與Translin超傢族同源的區域；BLAST比對顯示該氨基痠序列與Translin相關蛋白X(Translin associated protein X,TRAX)具有較高的同源性.結論:利用生物信息學技術穫得瞭舌鱗癌相關錶達序列標籤的基本信息,為深入研究該錶達序列標籤的功能奠定基礎.
목적:대이용억제소감잡교기술획득적설린암간세포상관표체서렬표첨(Expressed squence tag,EST)진행전자극륭급서렬분석.방법:이용호련망상적공공수거고급생물신식학분석연건대획득적설린암간세포상관차이표체서렬표첨진행핵산서렬화단백질서렬분석,탐색극륭차이표체기인적연구방법화책략.결과:통과전자연신득도1개1 705 bp적cDNA서렬；핵산서렬분석현시,해cDNA정위재1호염색체,함유1개편마146개안기산적완정개방열독광；대안기산서렬진행결구역예측현시기존재1개여Translin초가족동원적구역；BLAST비대현시해안기산서렬여Translin상관단백X(Translin associated protein X,TRAX)구유교고적동원성.결론:이용생물신식학기술획득료설린암상관표체서렬표첨적기본신식,위심입연구해표체서렬표첨적공능전정기출.
