生态学报
生態學報
생태학보
ACTA ECOLOGICA SINICA
2009年
9期
4798-4803
,共6页
马志杰%钟金城%韩建林%徐惊涛%窦全林%常怀普
馬誌傑%鐘金城%韓建林%徐驚濤%竇全林%常懷普
마지걸%종금성%한건림%서량도%두전림%상부보
野牦牛%线粒体DNA%D-Loop区%遗传多样性
野牦牛%線粒體DNA%D-Loop區%遺傳多樣性
야모우%선립체DNA%D-Loop구%유전다양성
为从分子水平上评价野牦牛(Bos grunniens mutus)的遗传多样性,对6头野牦公牛线粒体DNA D-loop 区全序列进行了克隆和测定(GenBank登录号为:FJ548840～FJ548845),结合GenBank中已刊登的2条野牦牛的相应序列,使用BioEdit 7 0 9、DnaSP 4.10.1、Arlequin 3.11等生物信息学软件,对全部8条序列开展了比对分析,确定了多态位点与单倍型数目,计算了核苷酸多样度和单倍型多样度.结果表明8条野牦牛线粒体DNA D-loop 区全序列长度在891～894 bp之间,其中A、T、G和C 4种核苷酸的平均含量分别为32.68%、28.65%、13.46%和25.21%,A+T的平均含量为61.33%.排除4处核苷酸的插入或缺失后,共检测到39处转换和颠换位点,占分析序列总长度的4.38%,其中包括4处单一多态位点和35处简约信息位点.依据序列间核苷酸变异共确定了7种单倍型,单倍型多样度(h)为0.9643,核苷酸多样度(π)为0.02144,提示野牦牛群体具有丰富的遗传多样性.
為從分子水平上評價野牦牛(Bos grunniens mutus)的遺傳多樣性,對6頭野牦公牛線粒體DNA D-loop 區全序列進行瞭剋隆和測定(GenBank登錄號為:FJ548840～FJ548845),結閤GenBank中已刊登的2條野牦牛的相應序列,使用BioEdit 7 0 9、DnaSP 4.10.1、Arlequin 3.11等生物信息學軟件,對全部8條序列開展瞭比對分析,確定瞭多態位點與單倍型數目,計算瞭覈苷痠多樣度和單倍型多樣度.結果錶明8條野牦牛線粒體DNA D-loop 區全序列長度在891～894 bp之間,其中A、T、G和C 4種覈苷痠的平均含量分彆為32.68%、28.65%、13.46%和25.21%,A+T的平均含量為61.33%.排除4處覈苷痠的插入或缺失後,共檢測到39處轉換和顛換位點,佔分析序列總長度的4.38%,其中包括4處單一多態位點和35處簡約信息位點.依據序列間覈苷痠變異共確定瞭7種單倍型,單倍型多樣度(h)為0.9643,覈苷痠多樣度(π)為0.02144,提示野牦牛群體具有豐富的遺傳多樣性.
위종분자수평상평개야모우(Bos grunniens mutus)적유전다양성,대6두야모공우선립체DNA D-loop 구전서렬진행료극륭화측정(GenBank등록호위:FJ548840～FJ548845),결합GenBank중이간등적2조야모우적상응서렬,사용BioEdit 7 0 9、DnaSP 4.10.1、Arlequin 3.11등생물신식학연건,대전부8조서렬개전료비대분석,학정료다태위점여단배형수목,계산료핵감산다양도화단배형다양도.결과표명8조야모우선립체DNA D-loop 구전서렬장도재891～894 bp지간,기중A、T、G화C 4충핵감산적평균함량분별위32.68%、28.65%、13.46%화25.21%,A+T적평균함량위61.33%.배제4처핵감산적삽입혹결실후,공검측도39처전환화전환위점,점분석서렬총장도적4.38%,기중포괄4처단일다태위점화35처간약신식위점.의거서렬간핵감산변이공학정료7충단배형,단배형다양도(h)위0.9643,핵감산다양도(π)위0.02144,제시야모우군체구유봉부적유전다양성.
