CAJ | 학술논문

根据减蛋综合征病毒(EDSV-76)AV-127株的全基因序列(序列号BK000404),用Premier 5.0软件设计22对引物,利用PCR方法对EDSV-76病毒NE4株的全基因组进行了分段扩增、克隆和序列测定,并用DNA Star分析软件对各片段的测序结果进行拼接,将该序列与GenBank中已登录的相应序列进行同源性分析,并用六邻体蛋白构建进化树.结果表明:NE4株基因组序列全长33 214 bp,GC含量为43 %,与国际标准株AV-127相比,核苷酸序列同源性为99.6 %.碱基的插入或缺失主要在非编码区,在100K蛋白编码区距羧基端1/10处插入了1个碱基C,其ORF编码696个氨基酸,而AV-127株100K蛋白编码709个氨基酸,预计其发挥功能的基团在N端.蛋白同源性分析表明,EDSV NE4株主要蛋白与羊腺病毒OAV(Ovine adenovirus D)、牛腺病毒BAV(Bovine adenovirus D)和蛇腺病毒SAV(Snake adenovirus)有较高的同源性,而与禽腺病毒Ⅰ群(CELO)的同源性较低,说明NE4株与禽腺病毒Ⅰ群亲缘关系较远,进化树分析也证实了此特性.
근거감단종합정병독(EDSV-76)AV-127주적전기인서렬(서렬호BK000404),용Premier 5.0연건설계22대인물,이용PCR방법대EDSV-76병독NE4주적전기인조진행료분단확증、극륭화서렬측정,병용DNA Star분석연건대각편단적측서결과진행병접,장해서렬여GenBank중이등록적상응서렬진행동원성분석,병용륙린체단백구건진화수.결과표명:NE4주기인조서렬전장33 214 bp,GC함량위43 %,여국제표준주AV-127상비,핵감산서렬동원성위99.6 %.감기적삽입혹결실주요재비편마구,재100K단백편마구거최기단1/10처삽입료1개감기C,기ORF편마696개안기산,이AV-127주100K단백편마709개안기산,예계기발휘공능적기단재N단.단백동원성분석표명,EDSV NE4주주요단백여양선병독OAV(Ovine adenovirus D)、우선병독BAV(Bovine adenovirus D)화사선병독SAV(Snake adenovirus)유교고적동원성,이여금선병독Ⅰ군(CELO)적동원성교저,설명NE4주여금선병독Ⅰ군친연관계교원,진화수분석야증실료차특성.