扬州大学学报(农业与生命科学版)
颺州大學學報(農業與生命科學版)
양주대학학보(농업여생명과학판)
JOURNAL OF YANGZHOU UNIVERSITY(AGRICULTURAL AND LIFE SCIENCE EDITION)
2007年
4期
36-41
,共6页
敖雁%胡治球%王学枫%徐辰武
敖雁%鬍治毬%王學楓%徐辰武
오안%호치구%왕학풍%서신무
八向杂交设计%QTL作图%极大似然估计%EM算法
八嚮雜交設計%QTL作圖%極大似然估計%EM算法
팔향잡교설계%QTL작도%겁대사연고계%EM산법
用8个纯系亲本杂交衍生的八向杂交设计分离群体进行QTL作图的新方法,先建立八向杂交设计的数量遗传模型及其基因型的两点概率转移矩阵,以此计算基因组任一假定座位QTL基因型的条件概率;然后根据混合分布理论建立基于EM(Expectation-maximization)算法实现的QTL区间作图的极大似然估计方法.方法的有效性通过计算机模拟分析加以验证,结果表明:对于信息完全的QTL位置和效应估计的准确度和精确度,除5个QTL位置的估计均很准确外,其余均表现为样本容量越大、QTL遗传力越高,其准确度和精确度越高,表现出令人满意的结果.对于信息不完全的QTL,其统计功效未因信息不完全而受影响.此外,在该模拟设置下,标记偏分离未使QTL的统计功效、位置和效应估计的准确度和精确度显著降低.
用8箇純繫親本雜交衍生的八嚮雜交設計分離群體進行QTL作圖的新方法,先建立八嚮雜交設計的數量遺傳模型及其基因型的兩點概率轉移矩陣,以此計算基因組任一假定座位QTL基因型的條件概率;然後根據混閤分佈理論建立基于EM(Expectation-maximization)算法實現的QTL區間作圖的極大似然估計方法.方法的有效性通過計算機模擬分析加以驗證,結果錶明:對于信息完全的QTL位置和效應估計的準確度和精確度,除5箇QTL位置的估計均很準確外,其餘均錶現為樣本容量越大、QTL遺傳力越高,其準確度和精確度越高,錶現齣令人滿意的結果.對于信息不完全的QTL,其統計功效未因信息不完全而受影響.此外,在該模擬設置下,標記偏分離未使QTL的統計功效、位置和效應估計的準確度和精確度顯著降低.
용8개순계친본잡교연생적팔향잡교설계분리군체진행QTL작도적신방법,선건립팔향잡교설계적수량유전모형급기기인형적량점개솔전이구진,이차계산기인조임일가정좌위QTL기인형적조건개솔;연후근거혼합분포이론건립기우EM(Expectation-maximization)산법실현적QTL구간작도적겁대사연고계방법.방법적유효성통과계산궤모의분석가이험증,결과표명:대우신식완전적QTL위치화효응고계적준학도화정학도,제5개QTL위치적고계균흔준학외,기여균표현위양본용량월대、QTL유전력월고,기준학도화정학도월고,표현출령인만의적결과.대우신식불완전적QTL,기통계공효미인신식불완전이수영향.차외,재해모의설치하,표기편분리미사QTL적통계공효、위치화효응고계적준학도화정학도현저강저.