激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2008年
5期
613-619
,共7页
猪瘟病毒%基因芯片%表达谱%可靠性%研究
豬瘟病毒%基因芯片%錶達譜%可靠性%研究
저온병독%기인심편%표체보%가고성%연구
通过同种组织RNA自身比较实验及不同组织RNA的差异分析实验对猪瘟病毒(classic swine fever virus, CSFV)cDNA芯片实验的重复性进行检验.利用相关系数(correlationcoefficient, R)、变异系数(coefficientofvariation, CV)和假阳性率(falsepositiverate, FPR)分析猪瘟病毒cDNA芯片数据的可靠程度,对cDNA芯片实验数据作了整体的评估.结果证实,该芯片系统得到的猪瘟病毒cDNA表达谱数据相关系数一般大于0.9,假阳性率控制在2 %以内.另外,通过比较猪瘟病毒芯片制备中点样浓度、mRNA和总RNA以及不同标记过程对实验的影响,来分析猪瘟病毒芯片数据的系统误差来源,得出结果:重复两次实验,可以克服绝大部分实验系统引入的假阳性.
通過同種組織RNA自身比較實驗及不同組織RNA的差異分析實驗對豬瘟病毒(classic swine fever virus, CSFV)cDNA芯片實驗的重複性進行檢驗.利用相關繫數(correlationcoefficient, R)、變異繫數(coefficientofvariation, CV)和假暘性率(falsepositiverate, FPR)分析豬瘟病毒cDNA芯片數據的可靠程度,對cDNA芯片實驗數據作瞭整體的評估.結果證實,該芯片繫統得到的豬瘟病毒cDNA錶達譜數據相關繫數一般大于0.9,假暘性率控製在2 %以內.另外,通過比較豬瘟病毒芯片製備中點樣濃度、mRNA和總RNA以及不同標記過程對實驗的影響,來分析豬瘟病毒芯片數據的繫統誤差來源,得齣結果:重複兩次實驗,可以剋服絕大部分實驗繫統引入的假暘性.
통과동충조직RNA자신비교실험급불동조직RNA적차이분석실험대저온병독(classic swine fever virus, CSFV)cDNA심편실험적중복성진행검험.이용상관계수(correlationcoefficient, R)、변이계수(coefficientofvariation, CV)화가양성솔(falsepositiverate, FPR)분석저온병독cDNA심편수거적가고정도,대cDNA심편실험수거작료정체적평고.결과증실,해심편계통득도적저온병독cDNA표체보수거상관계수일반대우0.9,가양성솔공제재2 %이내.령외,통과비교저온병독심편제비중점양농도、mRNA화총RNA이급불동표기과정대실험적영향,래분석저온병독심편수거적계통오차래원,득출결과:중복량차실험,가이극복절대부분실험계통인입적가양성.
