计算机工程
計算機工程
계산궤공정
COMPUTER ENGINEERING
2011年
9期
181-183
,共3页
聂俊岚%毛伟伟%王常武%王宝文%刘文远
聶俊嵐%毛偉偉%王常武%王寶文%劉文遠
섭준람%모위위%왕상무%왕보문%류문원
串联重复序列%离散傅里叶变换%电子离子相互作用势%频谱分析%信噪比
串聯重複序列%離散傅裏葉變換%電子離子相互作用勢%頻譜分析%信譟比
천련중복서렬%리산부리협변환%전자리자상호작용세%빈보분석%신조비
针对现有串联重复序列识别方法存在的计算量大、灵敏度低等问题,提出一种基于频谱分析的串联重复序列识别方法.该方法采用碱基的电子离子相互作用势作为基因序列数字化表示的方法,通过对数字序列作离散傅里叶变换得到序列中串联重复序列出现的频率,并对基因序列做加窗傅里叶变换,找出串联重复序列存在的位置.实验表明,该方法的计算量较已有方法减少了75%,并能较好地解决已有方法识别灵敏度低的缺点.
針對現有串聯重複序列識彆方法存在的計算量大、靈敏度低等問題,提齣一種基于頻譜分析的串聯重複序列識彆方法.該方法採用堿基的電子離子相互作用勢作為基因序列數字化錶示的方法,通過對數字序列作離散傅裏葉變換得到序列中串聯重複序列齣現的頻率,併對基因序列做加窗傅裏葉變換,找齣串聯重複序列存在的位置.實驗錶明,該方法的計算量較已有方法減少瞭75%,併能較好地解決已有方法識彆靈敏度低的缺點.
침대현유천련중복서렬식별방법존재적계산량대、령민도저등문제,제출일충기우빈보분석적천련중복서렬식별방법.해방법채용감기적전자리자상호작용세작위기인서렬수자화표시적방법,통과대수자서렬작리산부리협변환득도서렬중천련중복서렬출현적빈솔,병대기인서렬주가창부리협변환,조출천련중복서렬존재적위치.실험표명,해방법적계산량교이유방법감소료75%,병능교호지해결이유방법식별령민도저적결점.
