山东农业大学学报(自然科学版)
山東農業大學學報(自然科學版)
산동농업대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF SHANDONG AGRICULTURAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2009年
3期
393-397
,共5页
氧化还原%辅因子%生物信息学%化学信息学
氧化還原%輔因子%生物信息學%化學信息學
양화환원%보인자%생물신식학%화학신식학
为了探究氧化还原酶对不同辅因子的使用偏好性,使用生物信息学方法对40个物种体内氧化还原酶辅因子的使用频率进行了统计分析,发现古核生物和原核生物体内大约90%的氧化还原酶使用有机辅因子,真核生物体内约78%的氧化还原酶选择使用有机辅因子.为了进一步解释上述现象,一方面,对氧化还原反应方程式进行了分析,发现有机酶组约28.5%的反应需要氧气的参与;而金属酶组约63.2%的反应需要氧气的参与,由此我们推断氧气的出现有可能是导致金属辅因子使用频率升高的重要原因;另一方面,使用化学信息学方法对氧化还原反应涉及的小分子进行了化学性质的分析,发现有机酶组小分子的分子量和亲水性都比较高,由此我们推断金属辅因子更适于疏水的反应环境.
為瞭探究氧化還原酶對不同輔因子的使用偏好性,使用生物信息學方法對40箇物種體內氧化還原酶輔因子的使用頻率進行瞭統計分析,髮現古覈生物和原覈生物體內大約90%的氧化還原酶使用有機輔因子,真覈生物體內約78%的氧化還原酶選擇使用有機輔因子.為瞭進一步解釋上述現象,一方麵,對氧化還原反應方程式進行瞭分析,髮現有機酶組約28.5%的反應需要氧氣的參與;而金屬酶組約63.2%的反應需要氧氣的參與,由此我們推斷氧氣的齣現有可能是導緻金屬輔因子使用頻率升高的重要原因;另一方麵,使用化學信息學方法對氧化還原反應涉及的小分子進行瞭化學性質的分析,髮現有機酶組小分子的分子量和親水性都比較高,由此我們推斷金屬輔因子更適于疏水的反應環境.
위료탐구양화환원매대불동보인자적사용편호성,사용생물신식학방법대40개물충체내양화환원매보인자적사용빈솔진행료통계분석,발현고핵생물화원핵생물체내대약90%적양화환원매사용유궤보인자,진핵생물체내약78%적양화환원매선택사용유궤보인자.위료진일보해석상술현상,일방면,대양화환원반응방정식진행료분석,발현유궤매조약28.5%적반응수요양기적삼여;이금속매조약63.2%적반응수요양기적삼여,유차아문추단양기적출현유가능시도치금속보인자사용빈솔승고적중요원인;령일방면,사용화학신식학방법대양화환원반응섭급적소분자진행료화학성질적분석,발현유궤매조소분자적분자량화친수성도비교고,유차아문추단금속보인자경괄우소수적반응배경.