CAJ | 학술논문

对猪流感A/swine/HeBei/012/2008/ (H9N2)分离株血凝素(HA)基因进行了克隆和序列测定,与GenBank中收录的相关序列进行了比对并绘制了系统发育进化树.采用生物信息软件和互联网服务器,预测HA的二级结构,分析其表面特性(亲水性、柔韧性、可及性和抗原性),综合预测HA的B细胞抗原表位.结果显示:HA蛋白含有6个糖基化位点,剪切位点序列为PARSSR GLF,为低致病性流感病毒的裂解位点.HA基因核苷酸序列和推导的氨基酸的同源性与A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)最高,均为99％.HA基因进化树显示分离毒株与A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)位于同一分支,具有较近的亲缘关系；由此推测分离株可能是由A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)而来,在跨物种传播的过程中发生了部分变异.生物信息学预测结果表明:HA蛋白肽链的24-31、167-179、190-196、266-273和487-508区段为预测的B细胞表位优势区.
대저류감A/swine/HeBei/012/2008/ (H9N2)분리주혈응소(HA)기인진행료극륭화서렬측정,여GenBank중수록적상관서렬진행료비대병회제료계통발육진화수.채용생물신식연건화호련망복무기,예측HA적이급결구,분석기표면특성(친수성、유인성、가급성화항원성),종합예측HA적B세포항원표위.결과현시:HA단백함유6개당기화위점,전절위점서렬위PARSSR GLF,위저치병성류감병독적렬해위점.HA기인핵감산서렬화추도적안기산적동원성여A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)최고,균위99％.HA기인진화수현시분리독주여A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)위우동일분지,구유교근적친연관계；유차추측분리주가능시유A/chicken/Hebei/4/2008 (H9N2)이래,재과물충전파적과정중발생료부분변이.생물신식학예측결과표명:HA단백태련적24-31、167-179、190-196、266-273화487-508구단위예측적B세포표위우세구.