中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
20期
148-153
,共6页
姜娜%马志宏%侯莉%邢薇%李铁梁%罗琳
薑娜%馬誌宏%侯莉%邢薇%李鐵樑%囉琳
강나%마지굉%후리%형미%리철량%라림
虹鳟%抗菌肽%Hepcidin%cDNA克隆%序列分析
虹鱒%抗菌肽%Hepcidin%cDNA剋隆%序列分析
홍준%항균태%Hepcidin%cDNA극륭%서렬분석
为了从虹鳟肝脏中扩增出Hepcidinc全长DNA序列,预测出氨基酸序列,并进行序列分析.通过RT-PCR和RACE PCR的方法,从虹鳟肝脏中克隆获得了Hepcidin全长cDNA序列,利用在线工具和软件包分析.结果表明:虹鳟Hepcidin全长cDNA序列(GenBank登录号HQ71 1993)为883 bp,5’端非翻译区211bp,3’端非翻译区为405 bp,以及一段267 bp的编码序列,编码88个氨基酸,由信号肽(24个氨基酸)、原肽(39个氨基酸)和成熟肽(25个氨基酸)组成,成熟肽C端含有Hepcidin类抗菌肽的8个半胱氨酸保守性结构,可形成4个分子内二硫键.与已报道的鲑形目大西洋鲑Hepcidin氨基酸序列的一致性为93%,与其他鱼类Hepcidin氨基酸序列的一致性为44%~88%,是Hepcidin家族的新成员.
為瞭從虹鱒肝髒中擴增齣Hepcidinc全長DNA序列,預測齣氨基痠序列,併進行序列分析.通過RT-PCR和RACE PCR的方法,從虹鱒肝髒中剋隆穫得瞭Hepcidin全長cDNA序列,利用在線工具和軟件包分析.結果錶明:虹鱒Hepcidin全長cDNA序列(GenBank登錄號HQ71 1993)為883 bp,5’耑非翻譯區211bp,3’耑非翻譯區為405 bp,以及一段267 bp的編碼序列,編碼88箇氨基痠,由信號肽(24箇氨基痠)、原肽(39箇氨基痠)和成熟肽(25箇氨基痠)組成,成熟肽C耑含有Hepcidin類抗菌肽的8箇半胱氨痠保守性結構,可形成4箇分子內二硫鍵.與已報道的鮭形目大西洋鮭Hepcidin氨基痠序列的一緻性為93%,與其他魚類Hepcidin氨基痠序列的一緻性為44%~88%,是Hepcidin傢族的新成員.
위료종홍준간장중확증출Hepcidinc전장DNA서렬,예측출안기산서렬,병진행서렬분석.통과RT-PCR화RACE PCR적방법,종홍준간장중극륭획득료Hepcidin전장cDNA서렬,이용재선공구화연건포분석.결과표명:홍준Hepcidin전장cDNA서렬(GenBank등록호HQ71 1993)위883 bp,5’단비번역구211bp,3’단비번역구위405 bp,이급일단267 bp적편마서렬,편마88개안기산,유신호태(24개안기산)、원태(39개안기산)화성숙태(25개안기산)조성,성숙태C단함유Hepcidin류항균태적8개반광안산보수성결구,가형성4개분자내이류건.여이보도적해형목대서양해Hepcidin안기산서렬적일치성위93%,여기타어류Hepcidin안기산서렬적일치성위44%~88%,시Hepcidin가족적신성원.