华中农业大学学报
華中農業大學學報
화중농업대학학보
JOURNAL OF HUAZHONG AGRICULTURAL UNIVERSITY
2010年
4期
421-426
,共6页
香蕉束顶病毒%附加组分%序列分析
香蕉束頂病毒%附加組分%序列分析
향초속정병독%부가조분%서렬분석
采用PCR的方法分别克隆了香蕉束顶病毒(BBTV)广东分离物NS株系和NSP株系的附加组分,将之命名为BT-NS和BT-NSP.序列分析发现,2个附加组分基因全长均为1 094nt,其核苷酸的同源率为97.3%,编码氨基酸的同源率为98.4%;与BBTV台湾分离物附加组分S1、S2和越南分离物附加组分S3相比,BT-NS/NSP与S1的氨基酸序列相似率最高,与S2的相似率最低.每一附加组分的ORF均含有推导的与脱氧核苷酸结合的基序,具有潜在的复制酶活性.通过对BBTV编码复制酶基因组分的进化树分析发现,BT-NS/NSP与BBTV台湾附加组分S1的亲缘关系最近,与广东分离物NSP株系DNA组分1的亲缘关系较远.
採用PCR的方法分彆剋隆瞭香蕉束頂病毒(BBTV)廣東分離物NS株繫和NSP株繫的附加組分,將之命名為BT-NS和BT-NSP.序列分析髮現,2箇附加組分基因全長均為1 094nt,其覈苷痠的同源率為97.3%,編碼氨基痠的同源率為98.4%;與BBTV檯灣分離物附加組分S1、S2和越南分離物附加組分S3相比,BT-NS/NSP與S1的氨基痠序列相似率最高,與S2的相似率最低.每一附加組分的ORF均含有推導的與脫氧覈苷痠結閤的基序,具有潛在的複製酶活性.通過對BBTV編碼複製酶基因組分的進化樹分析髮現,BT-NS/NSP與BBTV檯灣附加組分S1的親緣關繫最近,與廣東分離物NSP株繫DNA組分1的親緣關繫較遠.
채용PCR적방법분별극륭료향초속정병독(BBTV)엄동분리물NS주계화NSP주계적부가조분,장지명명위BT-NS화BT-NSP.서렬분석발현,2개부가조분기인전장균위1 094nt,기핵감산적동원솔위97.3%,편마안기산적동원솔위98.4%;여BBTV태만분리물부가조분S1、S2화월남분리물부가조분S3상비,BT-NS/NSP여S1적안기산서렬상사솔최고,여S2적상사솔최저.매일부가조분적ORF균함유추도적여탈양핵감산결합적기서,구유잠재적복제매활성.통과대BBTV편마복제매기인조분적진화수분석발현,BT-NS/NSP여BBTV태만부가조분S1적친연관계최근,여엄동분리물NSP주계DNA조분1적친연관계교원.
