CAJ | 학술논문

根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因部分序列(761 bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点.共分析了采自福建省宁德市的16只拟穴青蟹,另外,从GenBank数据库中下载了31条前人提交的拟穴青蟹COI基因序列(长度在425-522 bp之间).利用MEGA 4.0软件对所有序列进行比对分析,结果表明碱基T、C、A和G的平均含量分别为37.6％、17.8％、28.9％和15.7％,G+C的含量平均为33.5％.分析结果表明,在所克隆的761bp的COI基因序列中共发现29个SNPs位点,其出现频率为3.8％.在这29个SNPs位点中,13个为C/T转换(占44.8％),12个为A/G转换(占41.4％),2个为A/T颠换(占6.90％),1个为G/C颠换(占3.45％),另有一个位点(201 bp处)发生了A/C颠换和C/T转换两种类型的碱基替换.氨基酸分析表明,在29个SNPs位点中,有9个位点属于非同义突变,引起了氨基酸的变化；其他20个位点属于同义突变,未引起氨基酸的变化.这将为拟穴青蟹遗传背景和群体遗传多样性研究提供新的分子标记.
근거의혈청해(Scylla paramamosain)선립체전서렬설계인물,채용PCR산물쌍향측서법,극륭료선립체세포색소C양화매아기Ⅰ(COI)기인부분서렬(761 bp),병사선、분석료의혈청해적SNPs위점.공분석료채자복건성저덕시적16지의혈청해,령외,종GenBank수거고중하재료31조전인제교적의혈청해COI기인서렬(장도재425-522 bp지간).이용MEGA 4.0연건대소유서렬진행비대분석,결과표명감기T、C、A화G적평균함량분별위37.6％、17.8％、28.9％화15.7％,G+C적함량평균위33.5％.분석결과표명,재소극륭적761bp적COI기인서렬중공발현29개SNPs위점,기출현빈솔위3.8％.재저29개SNPs위점중,13개위C/T전환(점44.8％),12개위A/G전환(점41.4％),2개위A/T전환(점6.90％),1개위G/C전환(점3.45％),령유일개위점(201 bp처)발생료A/C전환화C/T전환량충류형적감기체환.안기산분석표명,재29개SNPs위점중,유9개위점속우비동의돌변,인기료안기산적변화；기타20개위점속우동의돌변,미인기안기산적변화.저장위의혈청해유전배경화군체유전다양성연구제공신적분자표기.