生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2003年
2期
231-238
,共8页
酵母%内含子%基因转录频率%寡核苷酸出现频率
酵母%內含子%基因轉錄頻率%寡覈苷痠齣現頻率
효모%내함자%기인전록빈솔%과핵감산출현빈솔
大量实验研究显示,真核基因的许多内含子具有调控转录的功能,但是对此问题尚缺乏全面的研究.观察一些酵母基因的转录频率与基因的内含子序列后,发现一个值得注意的现象:转录频率高的基因内含子序列一般都比较长,而转录频率低的基因内含子一般都比较短.这提示高效转录基因的较长内含子中可能含有某些增强基因转录的特征性结构.于是选取两组酵母基因的内含子进行详细研究,第一组的基因具有较高的转录频率(>30),第二组的基因转录频率较低(≤10).对寡核苷酸(主要是四核苷酸、五核苷酸)的出现频率进行统计比较分析,探测到一批寡核苷酸,它们在第一组内含子中出现的频率显著高于在第二组内含子中出现的频率,同时也显著高于与第一组内含子相邻的外显子中的出现频率.其中一些寡核苷酸与实验研究得到的转录调控元件相同.从这批寡核苷酸在内含子和外显子序列中的分布看,高效转录基因内含子的序列结构确实有利于基因的转录.
大量實驗研究顯示,真覈基因的許多內含子具有調控轉錄的功能,但是對此問題尚缺乏全麵的研究.觀察一些酵母基因的轉錄頻率與基因的內含子序列後,髮現一箇值得註意的現象:轉錄頻率高的基因內含子序列一般都比較長,而轉錄頻率低的基因內含子一般都比較短.這提示高效轉錄基因的較長內含子中可能含有某些增彊基因轉錄的特徵性結構.于是選取兩組酵母基因的內含子進行詳細研究,第一組的基因具有較高的轉錄頻率(>30),第二組的基因轉錄頻率較低(≤10).對寡覈苷痠(主要是四覈苷痠、五覈苷痠)的齣現頻率進行統計比較分析,探測到一批寡覈苷痠,它們在第一組內含子中齣現的頻率顯著高于在第二組內含子中齣現的頻率,同時也顯著高于與第一組內含子相鄰的外顯子中的齣現頻率.其中一些寡覈苷痠與實驗研究得到的轉錄調控元件相同.從這批寡覈苷痠在內含子和外顯子序列中的分佈看,高效轉錄基因內含子的序列結構確實有利于基因的轉錄.
대량실험연구현시,진핵기인적허다내함자구유조공전록적공능,단시대차문제상결핍전면적연구.관찰일사효모기인적전록빈솔여기인적내함자서렬후,발현일개치득주의적현상:전록빈솔고적기인내함자서렬일반도비교장,이전록빈솔저적기인내함자일반도비교단.저제시고효전록기인적교장내함자중가능함유모사증강기인전록적특정성결구.우시선취량조효모기인적내함자진행상세연구,제일조적기인구유교고적전록빈솔(>30),제이조적기인전록빈솔교저(≤10).대과핵감산(주요시사핵감산、오핵감산)적출현빈솔진행통계비교분석,탐측도일비과핵감산,타문재제일조내함자중출현적빈솔현저고우재제이조내함자중출현적빈솔,동시야현저고우여제일조내함자상린적외현자중적출현빈솔.기중일사과핵감산여실험연구득도적전록조공원건상동.종저비과핵감산재내함자화외현자서렬중적분포간,고효전록기인내함자적서렬결구학실유리우기인적전록.
