中国生物医学工程学报
中國生物醫學工程學報
중국생물의학공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING
2006年
6期
694-699
,共6页
焦典%顾珉%傅静%李石法%谢建明%孙啸
焦典%顧珉%傅靜%李石法%謝建明%孫嘯
초전%고민%부정%리석법%사건명%손소
基因组%数据库%序列特征
基因組%數據庫%序列特徵
기인조%수거고%서렬특정
随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法.目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列时搜索速度很慢.针对基因组序列搜索的特点,从提高序列搜索效率出发,提出了一种新的、速度更快的搜索方法,其核心是通过序列特征的分析和比较搜索相似序列.在此基础上,建立了基于特征的序列数据库搜索系统,并利用序列的碱基关联性特征搜索人类基因组序列,结果表明,新搜索方法具有较高的命中率,并且搜索速度非常快,适合于大规模基因组序列的搜索.
隨著後基因組時代的到來,建立生物數據庫併且在其上開髮各種分析工具進行數據分析和挖掘,已經成為瞭生物學研究的一種新方法.目前國際上流行的通過序列比對搜索相似序列的方法主要是針對短的序列,將這樣的方法應用于大規模基因組序列時搜索速度很慢.針對基因組序列搜索的特點,從提高序列搜索效率齣髮,提齣瞭一種新的、速度更快的搜索方法,其覈心是通過序列特徵的分析和比較搜索相似序列.在此基礎上,建立瞭基于特徵的序列數據庫搜索繫統,併利用序列的堿基關聯性特徵搜索人類基因組序列,結果錶明,新搜索方法具有較高的命中率,併且搜索速度非常快,適閤于大規模基因組序列的搜索.
수착후기인조시대적도래,건립생물수거고병차재기상개발각충분석공구진행수거분석화알굴,이경성위료생물학연구적일충신방법.목전국제상류행적통과서렬비대수색상사서렬적방법주요시침대단적서렬,장저양적방법응용우대규모기인조서렬시수색속도흔만.침대기인조서렬수색적특점,종제고서렬수색효솔출발,제출료일충신적、속도경쾌적수색방법,기핵심시통과서렬특정적분석화비교수색상사서렬.재차기출상,건립료기우특정적서렬수거고수색계통,병이용서렬적감기관련성특정수색인류기인조서렬,결과표명,신수색방법구유교고적명중솔,병차수색속도비상쾌,괄합우대규모기인조서렬적수색.
