南方医科大学学报
南方醫科大學學報
남방의과대학학보
JOURNAL OF SOUTHERN MEDICAL UNIVERSITY
2009年
2期
185-190
,共6页
冯春琼%邹亚光%李铁求%周其赵%李飞%梁爽%毛向明
馮春瓊%鄒亞光%李鐵求%週其趙%李飛%樑爽%毛嚮明
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生物信息学%精子%卵子%特异表达基因
生物信息學%精子%卵子%特異錶達基因
생물신식학%정자%란자%특이표체기인
目的 研究精子中特异表达的基因,以加深对精子分子生物学的认识.方法 采用GATHER、PANTHER和DAVID等在线生物信息学分析工具,分析从GEO中下载的人正常精子、人正常卵子和人10种不同组织细胞混合样本的基因芯片杂交数据,从中挖掘出在精子中特异表达的基因及其表达特征.结果 人精子与正常对照组和人卵子细胞与正常对照组的差异基因筛选分析,分别得到8998和8981个差异表达基因.其中,有25个基因在精子中的表达量增加200倍.1709个在人精子高表达的基因探针(ratio大于5)中,有1218个在卵子细胞和正常对照组中表达无差异,有129个在卵子细胞中高表达,有362个在卵子细胞中低表达.精子中特异表达的基因主要位于蛋白质修饰与代谢、核苷酸代谢生物过程中,较少涉及细胞信号转导通路或在通路中发挥重要作用.此外,还发现:(1)有大量包含KRAB的转录因子和受体非依赖性的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在精子中特异性高表达;(2)精子中特异表达的部分基因高度集中在神经干细胞和胚胎干细胞的基因转录表达谱中;(3)精子中糖酵解相关的酶系低表达.结论 基于生物信息学的精子特异表达基因的挖掘,能充分利用不同的数据资源,更方便快捷地了解精子基因表达的全貌,加深对精子分子生物学的认识.
目的 研究精子中特異錶達的基因,以加深對精子分子生物學的認識.方法 採用GATHER、PANTHER和DAVID等在線生物信息學分析工具,分析從GEO中下載的人正常精子、人正常卵子和人10種不同組織細胞混閤樣本的基因芯片雜交數據,從中挖掘齣在精子中特異錶達的基因及其錶達特徵.結果 人精子與正常對照組和人卵子細胞與正常對照組的差異基因篩選分析,分彆得到8998和8981箇差異錶達基因.其中,有25箇基因在精子中的錶達量增加200倍.1709箇在人精子高錶達的基因探針(ratio大于5)中,有1218箇在卵子細胞和正常對照組中錶達無差異,有129箇在卵子細胞中高錶達,有362箇在卵子細胞中低錶達.精子中特異錶達的基因主要位于蛋白質脩飾與代謝、覈苷痠代謝生物過程中,較少涉及細胞信號轉導通路或在通路中髮揮重要作用.此外,還髮現:(1)有大量包含KRAB的轉錄因子和受體非依賴性的絲氨痠/囌氨痠蛋白激酶在精子中特異性高錶達;(2)精子中特異錶達的部分基因高度集中在神經榦細胞和胚胎榦細胞的基因轉錄錶達譜中;(3)精子中糖酵解相關的酶繫低錶達.結論 基于生物信息學的精子特異錶達基因的挖掘,能充分利用不同的數據資源,更方便快捷地瞭解精子基因錶達的全貌,加深對精子分子生物學的認識.
목적 연구정자중특이표체적기인,이가심대정자분자생물학적인식.방법 채용GATHER、PANTHER화DAVID등재선생물신식학분석공구,분석종GEO중하재적인정상정자、인정상란자화인10충불동조직세포혼합양본적기인심편잡교수거,종중알굴출재정자중특이표체적기인급기표체특정.결과 인정자여정상대조조화인란자세포여정상대조조적차이기인사선분석,분별득도8998화8981개차이표체기인.기중,유25개기인재정자중적표체량증가200배.1709개재인정자고표체적기인탐침(ratio대우5)중,유1218개재란자세포화정상대조조중표체무차이,유129개재란자세포중고표체,유362개재란자세포중저표체.정자중특이표체적기인주요위우단백질수식여대사、핵감산대사생물과정중,교소섭급세포신호전도통로혹재통로중발휘중요작용.차외,환발현:(1)유대량포함KRAB적전록인자화수체비의뢰성적사안산/소안산단백격매재정자중특이성고표체;(2)정자중특이표체적부분기인고도집중재신경간세포화배태간세포적기인전록표체보중;(3)정자중당효해상관적매계저표체.결론 기우생물신식학적정자특이표체기인적알굴,능충분이용불동적수거자원,경방편쾌첩지료해정자기인표체적전모,가심대정자분자생물학적인식.
