检验检疫科学
檢驗檢疫科學
검험검역과학
INSPECTION AND QUARANTINE SCIENCE
2004年
4期
16-19,22
,共5页
沈培垠%李红梅%HeYu%MauriceMoens
瀋培垠%李紅梅%HeYu%MauriceMoens
침배은%리홍매%HeYu%MauriceMoens
微卫星重复子%DOP-PCR%美洲剑线虫群组
微衛星重複子%DOP-PCR%美洲劍線蟲群組
미위성중복자%DOP-PCR%미주검선충군조
在美洲剑线虫群体(Xiphinema americanum group)上,应用简并寡核苷酸引物聚合酶链式反应(DOPPCR)技术,克服了基因组DNA样本不足的难题,成功在微量基因组DNA条件下分离和标记了微卫星重复子(Microsatellite).研究中,目标DNA片段被克隆前,DOP-PCR产物首先被连接到载体上,然后通过寡核苷酸(CA)9和载体上游引物,对包含微卫星位点的左侧DNA片段进行PCR扩增,该过程后的产物用于克隆和DNA序列分析;依据已分析的部分左侧序列,设计引物并与载体下游引物一起,对DOP-PCR产物再进行PCR扩增,使包含整个微卫星及其右侧连接部分被扩增,重复克隆和DNA序列分析并结合已分析的左侧序列,获得了包含全部微卫星重复子的DNA片段的完整序列.这种分离含微卫星标记位点DNA片段的路径新颖、高效,有效克隆率提高到了93.3%.研究中,发现和分析了9个包含微卫星重复子的片段,美洲剑线虫(X.americanum sensu stricto)和美洲剑线虫亚群组(X.americanum subgroup)的标记性引物被设计和检测.
在美洲劍線蟲群體(Xiphinema americanum group)上,應用簡併寡覈苷痠引物聚閤酶鏈式反應(DOPPCR)技術,剋服瞭基因組DNA樣本不足的難題,成功在微量基因組DNA條件下分離和標記瞭微衛星重複子(Microsatellite).研究中,目標DNA片段被剋隆前,DOP-PCR產物首先被連接到載體上,然後通過寡覈苷痠(CA)9和載體上遊引物,對包含微衛星位點的左側DNA片段進行PCR擴增,該過程後的產物用于剋隆和DNA序列分析;依據已分析的部分左側序列,設計引物併與載體下遊引物一起,對DOP-PCR產物再進行PCR擴增,使包含整箇微衛星及其右側連接部分被擴增,重複剋隆和DNA序列分析併結閤已分析的左側序列,穫得瞭包含全部微衛星重複子的DNA片段的完整序列.這種分離含微衛星標記位點DNA片段的路徑新穎、高效,有效剋隆率提高到瞭93.3%.研究中,髮現和分析瞭9箇包含微衛星重複子的片段,美洲劍線蟲(X.americanum sensu stricto)和美洲劍線蟲亞群組(X.americanum subgroup)的標記性引物被設計和檢測.
재미주검선충군체(Xiphinema americanum group)상,응용간병과핵감산인물취합매련식반응(DOPPCR)기술,극복료기인조DNA양본불족적난제,성공재미량기인조DNA조건하분리화표기료미위성중복자(Microsatellite).연구중,목표DNA편단피극륭전,DOP-PCR산물수선피련접도재체상,연후통과과핵감산(CA)9화재체상유인물,대포함미위성위점적좌측DNA편단진행PCR확증,해과정후적산물용우극륭화DNA서렬분석;의거이분석적부분좌측서렬,설계인물병여재체하유인물일기,대DOP-PCR산물재진행PCR확증,사포함정개미위성급기우측련접부분피확증,중복극륭화DNA서렬분석병결합이분석적좌측서렬,획득료포함전부미위성중복자적DNA편단적완정서렬.저충분리함미위성표기위점DNA편단적로경신영、고효,유효극륭솔제고도료93.3%.연구중,발현화분석료9개포함미위성중복자적편단,미주검선충(X.americanum sensu stricto)화미주검선충아군조(X.americanum subgroup)적표기성인물피설계화검측.