云南民族大学学报(自然科学版)
雲南民族大學學報(自然科學版)
운남민족대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF YUNNAN UNIVERSITY FOR NATIONALITIES（NATURAL SCIENCES EDITION）
2009年
1期
37-40
,共4页
王宁%邓圣荣%金毅%徐四川%何耀莹
王寧%鄧聖榮%金毅%徐四川%何耀瑩
왕저%산골영%금의%서사천%하요형
HIV-1%1RT1蛋白%MKC%结合位点%DFT
HIV-1%1RT1蛋白%MKC%結閤位點%DFT
HIV-1%1RT1단백%MKC%결합위점%DFT
1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,P)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ·mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.
1RT1蛋白是一箇HIV-1逆轉錄酶覈心蛋白,是抑製劑藥物分子的作用靶點.非覈苷類抑製劑MKC分子是1RT1蛋白中的配體分子.採用量子力學密度汎函理論,B3LYP計算方法,結閤6-31G(d,P)基組,逐箇計算MKC分子與其週圍半徑0.7 nm結構範圍內的34箇氨基痠殘基相互作用和結閤能,髮現在1RT1蛋白中103Lys殘基是MKC分子的結閤作用位點,結閤能值為-46.73 kJ·mol-1.該結閤位點的髮現將為進一步設計和尋找抗HIV-1逆轉錄酶抑製劑藥物分子提供一些理論基礎.
1RT1단백시일개HIV-1역전록매핵심단백,시억제제약물분자적작용파점.비핵감류억제제MKC분자시1RT1단백중적배체분자.채용양자역학밀도범함이론,B3LYP계산방법,결합6-31G(d,P)기조,축개계산MKC분자여기주위반경0.7 nm결구범위내적34개안기산잔기상호작용화결합능,발현재1RT1단백중103Lys잔기시MKC분자적결합작용위점,결합능치위-46.73 kJ·mol-1.해결합위점적발현장위진일보설계화심조항HIV-1역전록매억제제약물분자제공일사이론기출.
