广东海洋大学学报
廣東海洋大學學報
엄동해양대학학보
JOURNAL OF GUANGDONG OCEAN UNIVERSITY
2011年
6期
20-25
,共6页
邓思平%李嘉颖%张婉玲%宋春杰%李广丽%朱春华%吴天利
鄧思平%李嘉穎%張婉玲%宋春傑%李廣麗%硃春華%吳天利
산사평%리가영%장완령%송춘걸%리엄려%주춘화%오천리
勒氏笛鲷%肌肉生长抑制素(MSTN)%基因%克隆%序列分析
勒氏笛鯛%肌肉生長抑製素(MSTN)%基因%剋隆%序列分析
륵씨적조%기육생장억제소(MSTN)%기인%극륭%서렬분석
以勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)基因组DNA为模板,采用同源克隆的方法,获得2887bp的肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因组序列,该MSTN序列具有3个外显子和2个内含子,包括101bp的5′-UTR、385bp的外显子1、354bp的内含子1、370bp的外显子2、761bp的内含子2、381bp的外显子3和1932bp的3′-UTR.整个开放阅读框编码了378个氨基酸,前面的22个氨基酸为信号肽,具有9个保守的半胱氨基酸及一个RVRR的蛋白酶解加工位点.氨基酸序列分析发现,该基因编码的蛋白质与其他鱼类的Ⅰ型同源性较高,与其他鱼类的2型MSTN同源性较低,且与鲈形目的同源性最高,与鲤形目的同源性较低,与人、鼠和鸡的同源性最低.采用邻接法(Neighbor-Joining)构建的MSTN的系统发育树表明,勒氏笛鲷MSTN与鲈形目鱼类的狼鲈属亲缘关系较近,且与鱼类的MSTN-1聚为1支.这表明该基因属于Ⅰ型MSTN基因.
以勒氏笛鯛(Lutjanus russellii)基因組DNA為模闆,採用同源剋隆的方法,穫得2887bp的肌肉生長抑製素(myostatin,MSTN)基因組序列,該MSTN序列具有3箇外顯子和2箇內含子,包括101bp的5′-UTR、385bp的外顯子1、354bp的內含子1、370bp的外顯子2、761bp的內含子2、381bp的外顯子3和1932bp的3′-UTR.整箇開放閱讀框編碼瞭378箇氨基痠,前麵的22箇氨基痠為信號肽,具有9箇保守的半胱氨基痠及一箇RVRR的蛋白酶解加工位點.氨基痠序列分析髮現,該基因編碼的蛋白質與其他魚類的Ⅰ型同源性較高,與其他魚類的2型MSTN同源性較低,且與鱸形目的同源性最高,與鯉形目的同源性較低,與人、鼠和鷄的同源性最低.採用鄰接法(Neighbor-Joining)構建的MSTN的繫統髮育樹錶明,勒氏笛鯛MSTN與鱸形目魚類的狼鱸屬親緣關繫較近,且與魚類的MSTN-1聚為1支.這錶明該基因屬于Ⅰ型MSTN基因.
이륵씨적조(Lutjanus russellii)기인조DNA위모판,채용동원극륭적방법,획득2887bp적기육생장억제소(myostatin,MSTN)기인조서렬,해MSTN서렬구유3개외현자화2개내함자,포괄101bp적5′-UTR、385bp적외현자1、354bp적내함자1、370bp적외현자2、761bp적내함자2、381bp적외현자3화1932bp적3′-UTR.정개개방열독광편마료378개안기산,전면적22개안기산위신호태,구유9개보수적반광안기산급일개RVRR적단백매해가공위점.안기산서렬분석발현,해기인편마적단백질여기타어류적Ⅰ형동원성교고,여기타어류적2형MSTN동원성교저,차여로형목적동원성최고,여리형목적동원성교저,여인、서화계적동원성최저.채용린접법(Neighbor-Joining)구건적MSTN적계통발육수표명,륵씨적조MSTN여로형목어류적랑로속친연관계교근,차여어류적MSTN-1취위1지.저표명해기인속우Ⅰ형MSTN기인.
