遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2011年
9期
901-910
,共10页
李放歌%王志鹏%户国%李辉
李放歌%王誌鵬%戶國%李輝
리방가%왕지붕%호국%리휘
全基因组交互分析%复杂疾病/性状%统计方法
全基因組交互分析%複雜疾病/性狀%統計方法
전기인조교호분석%복잡질병/성상%통계방법
利用高密度单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记在全基因组范围内检测影响复杂疾病/性状的染色体区段或基因,已经成为目前遗传学领域新的突破点之一.在全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)取得大量成果之后,研究者们对在全基因范围内研究交互作用产生了极大的热情.近几年,对交互作用的研究,无论是在方法的研发、实际的应用以及统计学上的交互向生物学上的交互转化,还是在信息组学的整合,都呈现快速发展的趋势,已有很多策略和方法被尝试用于进行全基因组交互作用分析,这些研究推动了对复杂疾病/性状遗传机制的进一步认识.基于目前全基因组交互分析所采用的各类数据处理方法的理论与算法的异同,文章拟对目前使用较为广泛的回归类方法、机器学习方法、贝叶斯模型法、SNP筛选类方法和基于并行程序的方法等5类方法加以评述,着重介绍了这些方法的算法原理、计算效率以及差别之处,以期能够为相关领域的研究者提供参考.
利用高密度單覈苷痠多態(Single nucleotide polymorphism,SNP)標記在全基因組範圍內檢測影響複雜疾病/性狀的染色體區段或基因,已經成為目前遺傳學領域新的突破點之一.在全基因組關聯研究(Genome-wide association study,GWAS)取得大量成果之後,研究者們對在全基因範圍內研究交互作用產生瞭極大的熱情.近幾年,對交互作用的研究,無論是在方法的研髮、實際的應用以及統計學上的交互嚮生物學上的交互轉化,還是在信息組學的整閤,都呈現快速髮展的趨勢,已有很多策略和方法被嘗試用于進行全基因組交互作用分析,這些研究推動瞭對複雜疾病/性狀遺傳機製的進一步認識.基于目前全基因組交互分析所採用的各類數據處理方法的理論與算法的異同,文章擬對目前使用較為廣汎的迴歸類方法、機器學習方法、貝葉斯模型法、SNP篩選類方法和基于併行程序的方法等5類方法加以評述,著重介紹瞭這些方法的算法原理、計算效率以及差彆之處,以期能夠為相關領域的研究者提供參攷.
이용고밀도단핵감산다태(Single nucleotide polymorphism,SNP)표기재전기인조범위내검측영향복잡질병/성상적염색체구단혹기인,이경성위목전유전학영역신적돌파점지일.재전기인조관련연구(Genome-wide association study,GWAS)취득대량성과지후,연구자문대재전기인범위내연구교호작용산생료겁대적열정.근궤년,대교호작용적연구,무론시재방법적연발、실제적응용이급통계학상적교호향생물학상적교호전화,환시재신식조학적정합,도정현쾌속발전적추세,이유흔다책략화방법피상시용우진행전기인조교호작용분석,저사연구추동료대복잡질병/성상유전궤제적진일보인식.기우목전전기인조교호분석소채용적각류수거처리방법적이론여산법적이동,문장의대목전사용교위엄범적회귀류방법、궤기학습방법、패협사모형법、SNP사선류방법화기우병행정서적방법등5류방법가이평술,착중개소료저사방법적산법원리、계산효솔이급차별지처,이기능구위상관영역적연구자제공삼고.