时珍国医国药
時珍國醫國藥
시진국의국약
LISHIZHEN MEDICINE AND MATERIA MEDICA RESEARCH
2011年
12期
2836-2839
,共4页
杨雷%马长德%谢东霞%徐国昌%毛秉豫%周冬生
楊雷%馬長德%謝東霞%徐國昌%毛秉豫%週鼕生
양뢰%마장덕%사동하%서국창%모병예%주동생
副溶血弧菌%牛磺酸%芯片%转录调控
副溶血弧菌%牛磺痠%芯片%轉錄調控
부용혈호균%우광산%심편%전록조공
目的 利用全基因组DNA芯片技术分析牛磺酸作用下副溶血弧菌基因转录变化概况,界定受牛磺酸直接调控的基因,研究其表达调控变化规律.方法 分别采用“牛磺酸持续刺激培养(CTG)”和“中间添加牛磺酸刺激培养(STG)”方案,在副溶血弧菌生长的培养基中添加50 mmol/L牛磺酸,孵育至对数中期OD600=1.2,收集菌体,提取RNA,应用全基因组DNA芯片分别分析比较其和正常对照组的基因转录变化特征,并对比分析两个不同的转录表达谱基因变化特点,界定出可能受牛磺酸直接调控的基因群.同时,应用实时定量逆转录多聚酶联反应对芯片结果进行验证.结果 和对照组相比,CTG实验中,总计有255个基因的转录表达发生显著性变化,上调的基因明显占主导优势;STG实验中,共有129个基因的转录表达发生显著性变化,同样以上调的基因占优势地位.综合分析两个表达谱基因转录表达特征表明,44个基因可能受牛磺酸直接影响调控,分别涉及硫代谢、谷胱氨酸代谢、铁离子代谢、核糖体加工合成等.实时定量逆转录多聚酶联反应结果证实其和芯片数据结果有很强的相关性.结论 我们应用DNA芯片技术描绘出了受牛磺酸影响的副溶血弧菌基因转录表达变化概图,并推测,蛤蜊、扇贝等海洋生物体内含量丰富的牛磺酸资源可能为副溶血弧菌的滋生和繁殖提供了重要保障.
目的 利用全基因組DNA芯片技術分析牛磺痠作用下副溶血弧菌基因轉錄變化概況,界定受牛磺痠直接調控的基因,研究其錶達調控變化規律.方法 分彆採用“牛磺痠持續刺激培養(CTG)”和“中間添加牛磺痠刺激培養(STG)”方案,在副溶血弧菌生長的培養基中添加50 mmol/L牛磺痠,孵育至對數中期OD600=1.2,收集菌體,提取RNA,應用全基因組DNA芯片分彆分析比較其和正常對照組的基因轉錄變化特徵,併對比分析兩箇不同的轉錄錶達譜基因變化特點,界定齣可能受牛磺痠直接調控的基因群.同時,應用實時定量逆轉錄多聚酶聯反應對芯片結果進行驗證.結果 和對照組相比,CTG實驗中,總計有255箇基因的轉錄錶達髮生顯著性變化,上調的基因明顯佔主導優勢;STG實驗中,共有129箇基因的轉錄錶達髮生顯著性變化,同樣以上調的基因佔優勢地位.綜閤分析兩箇錶達譜基因轉錄錶達特徵錶明,44箇基因可能受牛磺痠直接影響調控,分彆涉及硫代謝、穀胱氨痠代謝、鐵離子代謝、覈糖體加工閤成等.實時定量逆轉錄多聚酶聯反應結果證實其和芯片數據結果有很彊的相關性.結論 我們應用DNA芯片技術描繪齣瞭受牛磺痠影響的副溶血弧菌基因轉錄錶達變化概圖,併推測,蛤蜊、扇貝等海洋生物體內含量豐富的牛磺痠資源可能為副溶血弧菌的滋生和繁殖提供瞭重要保障.
목적 이용전기인조DNA심편기술분석우광산작용하부용혈호균기인전록변화개황,계정수우광산직접조공적기인,연구기표체조공변화규률.방법 분별채용“우광산지속자격배양(CTG)”화“중간첨가우광산자격배양(STG)”방안,재부용혈호균생장적배양기중첨가50 mmol/L우광산,부육지대수중기OD600=1.2,수집균체,제취RNA,응용전기인조DNA심편분별분석비교기화정상대조조적기인전록변화특정,병대비분석량개불동적전록표체보기인변화특점,계정출가능수우광산직접조공적기인군.동시,응용실시정량역전록다취매련반응대심편결과진행험증.결과 화대조조상비,CTG실험중,총계유255개기인적전록표체발생현저성변화,상조적기인명현점주도우세;STG실험중,공유129개기인적전록표체발생현저성변화,동양이상조적기인점우세지위.종합분석량개표체보기인전록표체특정표명,44개기인가능수우광산직접영향조공,분별섭급류대사、곡광안산대사、철리자대사、핵당체가공합성등.실시정량역전록다취매련반응결과증실기화심편수거결과유흔강적상관성.결론 아문응용DNA심편기술묘회출료수우광산영향적부용혈호균기인전록표체변화개도,병추측,합리、선패등해양생물체내함량봉부적우광산자원가능위부용혈호균적자생화번식제공료중요보장.