水产科学
水產科學
수산과학
FISHERIES SCIENCE
2012年
7期
429-432
,共4页
许志强%葛家春%李跃华%朱清顺%潘建林
許誌彊%葛傢春%李躍華%硃清順%潘建林
허지강%갈가춘%리약화%주청순%반건림
中华绒螯蟹%种质鉴定%SCAR
中華絨螯蟹%種質鑒定%SCAR
중화융오해%충질감정%SCAR
通过克隆测序获取了中华绒螯蟹Opp17目的片段,分析其长度、碱基组成等序列特征.序列测定结果表明,克隆片段的准确大小为1170 bp,G+C含量为50.34％,Opp17 (TGACCCGCCT)引物与所测序列中的引物结合位点完全匹配.在GenBank中对序列进行BLast检索,未找到任何同源序列.在此基础上,在原有随机引物Opp17的基础上向3′端延伸13～19个nt以设计SCAR引物,最终设计了1对中华绒螯蟹特异性SCAR(sequence characterized ampLified regions,序列特征化扩增区)引物SCAR-1( F-TGACCCGCCTCAGCACCCGAACG; R-TGACCCGCCTCTCAGCCACACACC).利用这对引物对长江天然群体中华绒螯蟹基因组DNA进行PCR扩增,结果表明所有个体均能扩增出预期大小1170 bp的特异性条带.对目的条带进行回收测序,结果与之前的测序结果完全一致,表明本研究已成功获取了中华绒螯蟹种质鉴定国家标准中Oppl7目的条带的SCAR标记.
通過剋隆測序穫取瞭中華絨螯蟹Opp17目的片段,分析其長度、堿基組成等序列特徵.序列測定結果錶明,剋隆片段的準確大小為1170 bp,G+C含量為50.34％,Opp17 (TGACCCGCCT)引物與所測序列中的引物結閤位點完全匹配.在GenBank中對序列進行BLast檢索,未找到任何同源序列.在此基礎上,在原有隨機引物Opp17的基礎上嚮3′耑延伸13～19箇nt以設計SCAR引物,最終設計瞭1對中華絨螯蟹特異性SCAR(sequence characterized ampLified regions,序列特徵化擴增區)引物SCAR-1( F-TGACCCGCCTCAGCACCCGAACG; R-TGACCCGCCTCTCAGCCACACACC).利用這對引物對長江天然群體中華絨螯蟹基因組DNA進行PCR擴增,結果錶明所有箇體均能擴增齣預期大小1170 bp的特異性條帶.對目的條帶進行迴收測序,結果與之前的測序結果完全一緻,錶明本研究已成功穫取瞭中華絨螯蟹種質鑒定國傢標準中Oppl7目的條帶的SCAR標記.
통과극륭측서획취료중화융오해Opp17목적편단,분석기장도、감기조성등서렬특정.서렬측정결과표명,극륭편단적준학대소위1170 bp,G+C함량위50.34％,Opp17 (TGACCCGCCT)인물여소측서렬중적인물결합위점완전필배.재GenBank중대서렬진행BLast검색,미조도임하동원서렬.재차기출상,재원유수궤인물Opp17적기출상향3′단연신13～19개nt이설계SCAR인물,최종설계료1대중화융오해특이성SCAR(sequence characterized ampLified regions,서렬특정화확증구)인물SCAR-1( F-TGACCCGCCTCAGCACCCGAACG; R-TGACCCGCCTCTCAGCCACACACC).이용저대인물대장강천연군체중화융오해기인조DNA진행PCR확증,결과표명소유개체균능확증출예기대소1170 bp적특이성조대.대목적조대진행회수측서,결과여지전적측서결과완전일치,표명본연구이성공획취료중화융오해충질감정국가표준중Oppl7목적조대적SCAR표기.
