热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2011年
4期
663-667
,共5页
漆艳香%蒲金基%张欣%陆英%张贺%张辉强%谢艺贤
漆豔香%蒲金基%張訢%陸英%張賀%張輝彊%謝藝賢
칠염향%포금기%장흔%륙영%장하%장휘강%사예현
芒果细菌性黑斑病菌%群体感应%XcmR%生物信息学
芒果細菌性黑斑病菌%群體感應%XcmR%生物信息學
망과세균성흑반병균%군체감응%XcmR%생물신식학
根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4kb的DNA片段.经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR.生物信息学分析表明,XcmR基因完整0RF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhvR/AsaR氨基酸序列具有86％～99％相似性.系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支.NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构.
根據黃單孢菌屬LuxR基因的同源性設計簡併引物XF/XR,採用同源剋隆法從芒果細菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中穫得瞭約1.4kb的DNA片段.經測序和序列同源性分析錶明,該基因片段長1 422 bp含有一箇完整的LuxR同源基因,併命名為XcmR.生物信息學分析錶明,XcmR基因完整0RF(開放閱讀框)全長765 bp,編碼254箇氨基痠,分子質量和等電點分彆約為28.2 ku和8.9,與GenBank中公佈的Xanthomonas屬LuxR或AhvR/AsaR氨基痠序列具有86％～99％相似性.繫統聚類結果錶明,XcmR與來源于柑桔潰瘍病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄瘡痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白葉枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘藍黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支.NCBI網站蛋白質保守結構域搜索錶明,XcmR是LuxR蛋白傢族的一員,具有LuxR蛋白相似結構.
근거황단포균속LuxR기인적동원성설계간병인물XF/XR,채용동원극륭법종망과세균성흑반병균(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)중획득료약1.4kb적DNA편단.경측서화서렬동원성분석표명,해기인편단장1 422 bp함유일개완정적LuxR동원기인,병명명위XcmR.생물신식학분석표명,XcmR기인완정0RF(개방열독광)전장765 bp,편마254개안기산,분자질량화등전점분별약위28.2 ku화8.9,여GenBank중공포적Xanthomonas속LuxR혹AhvR/AsaR안기산서렬구유86％～99％상사성.계통취류결과표명,XcmR여래원우감길궤양병균(X.axonopodis pv.citri)、번가창가병균(X.c.pv.vesicatoria)、수도백협고균(X.oryzae pv.oryzae)화감람흑부병균(X.c.pv.campestris)적LuxR단백취성일지.NCBI망참단백질보수결구역수색표명,XcmR시LuxR단백가족적일원,구유LuxR단백상사결구.
