CAJ | 학술논문

高通量微阵列技术与手工表型标定方式间的矛盾导致了基因表达数据的获取与表型确定间的不平衡.然而,已有的表型区分方法大多是有监督的,并且通常忽略了基因间广泛存在的相互作用,根据单个基因的独立区分能力划分样本表型,选择相关基因.从新的视角,基于投影聚类的思想,提出一种考虑基因间相互关系的无监督表型区分算法USPD.通过将基因表达数据转化为具有负间隔约束的序列数据,强化了基因间的相互关系.利用设计的质量函数,采用深度优先方式遍历样本穷举树,无监督地生成样本表型划分.同时采用高效的削减策略,大大提高了算法的效率.通过将算法与现有的以基因表达数据分析为目的的代表性投影聚类算法HARP相比较,证明提出算法的高效性和有效性.
고통량미진렬기술여수공표형표정방식간적모순도치료기인표체수거적획취여표형학정간적불평형.연이,이유적표형구분방법대다시유감독적,병차통상홀략료기인간엄범존재적상호작용,근거단개기인적독립구분능력화분양본표형,선택상관기인.종신적시각,기우투영취류적사상,제출일충고필기인간상호관계적무감독표형구분산법USPD.통과장기인표체수거전화위구유부간격약속적서렬수거,강화료기인간적상호관계.이용설계적질량함수,채용심도우선방식편력양본궁거수,무감독지생성양본표형화분.동시채용고효적삭감책략,대대제고료산법적효솔.통과장산법여현유적이기인표체수거분석위목적적대표성투영취류산법HARP상비교,증명제출산법적고효성화유효성.