生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2012年
1期
8-11
,共4页
吴毕莎%柯崇榕%林晓华%林清强%陈由强%黄建忠
吳畢莎%柯崇榕%林曉華%林清彊%陳由彊%黃建忠
오필사%가숭용%림효화%림청강%진유강%황건충
SNF4%酿酒酵母%ADH2%生物信息学
SNF4%釀酒酵母%ADH2%生物信息學
SNF4%양주효모%ADH2%생물신식학
SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列.序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基.应用生物信息方法预测其理化性质、疏水性、信号肽、亚细胞定位、活性位点及其高级结构.结果表明:Snf4p为具有一定亲水性的非跨膜胞内稳定酸性蛋白,功能结构域为CBS_pair superfamily结构域,二级结构主要由a-螺旋组成,空间结构是由4个CBS结构域构成两个CBS对围绕形成的二聚体.Snf4p的第一个CBS对区域的β片层结构是Snf1p、Sip2p的β发夹结构结合作用区.
SNF4基因編碼的Snf4p具有調節Snf1複閤體的蛋白激酶活性功能,根據已知的SNF4基因序列設計引物擴增穫得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列.序列分析錶明,SNF4基因的開放閱讀框為969bp,編碼322箇氨基痠殘基.應用生物信息方法預測其理化性質、疏水性、信號肽、亞細胞定位、活性位點及其高級結構.結果錶明:Snf4p為具有一定親水性的非跨膜胞內穩定痠性蛋白,功能結構域為CBS_pair superfamily結構域,二級結構主要由a-螺鏇組成,空間結構是由4箇CBS結構域構成兩箇CBS對圍繞形成的二聚體.Snf4p的第一箇CBS對區域的β片層結構是Snf1p、Sip2p的β髮夾結構結閤作用區.
SNF4기인편마적Snf4p구유조절Snf1복합체적단백격매활성공능,근거이지적SNF4기인서렬설계인물확증획득S.cerevisiae YS2적SNF4기인완정서렬.서렬분석표명,SNF4기인적개방열독광위969bp,편마322개안기산잔기.응용생물신식방법예측기이화성질、소수성、신호태、아세포정위、활성위점급기고급결구.결과표명:Snf4p위구유일정친수성적비과막포내은정산성단백,공능결구역위CBS_pair superfamily결구역,이급결구주요유a-라선조성,공간결구시유4개CBS결구역구성량개CBS대위요형성적이취체.Snf4p적제일개CBS대구역적β편층결구시Snf1p、Sip2p적β발협결구결합작용구.
