中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2008年
1期
22-29
,共8页
刘丽%刘楚吾%郭昱嵩%董秋芬%徐田军
劉麗%劉楚吾%郭昱嵩%董鞦芬%徐田軍
류려%류초오%곽욱숭%동추분%서전군
青石斑鱼%基因组文库%PCR法%微卫星标记%遗传多样性
青石斑魚%基因組文庫%PCR法%微衛星標記%遺傳多樣性
청석반어%기인조문고%PCR법%미위성표기%유전다양성
以中国南海海域青石斑鱼(Epinephelus awoara)为材料,构建青石斑鱼小片段部分基因组DNA文库.以M13通用引物和设计合成的微卫星核心序列引物(CA)15,用PCR法对文库进行筛选,共获得96个微卫星序列,分别分布于28个阳性重组克隆中,其中perfect(完美型)共39个(占40.6%),imperfect(非完美型)30个(占31.3%),compound perfect(混合完美型)7个(占7.3%),compound imperfect(混合非完美型)20个(占20.8%).同时发现(CA/GT)n序列在青石斑鱼的基因组DNA中含量非常丰富.根据微卫星侧翼序列设计28对引物扩增青石斑鱼基因组DNA,有26对引物能扩增出目的片段,选用其中13对多态性稳定的引物对19尾青石斑鱼进行遗传多样性分析.结果显示,13个位点共检测到48个等位基因,平均观测杂合度(Ho)为0.598 2,平均期望杂合度(He)为0.508 0,平均多态信息含量(PIC)为0.472 2,平均Hardy-Weinberg遗传偏离指数(D)为0.150 3.实验初步表明中国南海海域青石斑鱼的遗传多样性较为丰富,但在某种程度上受到了人为的干扰.
以中國南海海域青石斑魚(Epinephelus awoara)為材料,構建青石斑魚小片段部分基因組DNA文庫.以M13通用引物和設計閤成的微衛星覈心序列引物(CA)15,用PCR法對文庫進行篩選,共穫得96箇微衛星序列,分彆分佈于28箇暘性重組剋隆中,其中perfect(完美型)共39箇(佔40.6%),imperfect(非完美型)30箇(佔31.3%),compound perfect(混閤完美型)7箇(佔7.3%),compound imperfect(混閤非完美型)20箇(佔20.8%).同時髮現(CA/GT)n序列在青石斑魚的基因組DNA中含量非常豐富.根據微衛星側翼序列設計28對引物擴增青石斑魚基因組DNA,有26對引物能擴增齣目的片段,選用其中13對多態性穩定的引物對19尾青石斑魚進行遺傳多樣性分析.結果顯示,13箇位點共檢測到48箇等位基因,平均觀測雜閤度(Ho)為0.598 2,平均期望雜閤度(He)為0.508 0,平均多態信息含量(PIC)為0.472 2,平均Hardy-Weinberg遺傳偏離指數(D)為0.150 3.實驗初步錶明中國南海海域青石斑魚的遺傳多樣性較為豐富,但在某種程度上受到瞭人為的榦擾.
이중국남해해역청석반어(Epinephelus awoara)위재료,구건청석반어소편단부분기인조DNA문고.이M13통용인물화설계합성적미위성핵심서렬인물(CA)15,용PCR법대문고진행사선,공획득96개미위성서렬,분별분포우28개양성중조극륭중,기중perfect(완미형)공39개(점40.6%),imperfect(비완미형)30개(점31.3%),compound perfect(혼합완미형)7개(점7.3%),compound imperfect(혼합비완미형)20개(점20.8%).동시발현(CA/GT)n서렬재청석반어적기인조DNA중함량비상봉부.근거미위성측익서렬설계28대인물확증청석반어기인조DNA,유26대인물능확증출목적편단,선용기중13대다태성은정적인물대19미청석반어진행유전다양성분석.결과현시,13개위점공검측도48개등위기인,평균관측잡합도(Ho)위0.598 2,평균기망잡합도(He)위0.508 0,평균다태신식함량(PIC)위0.472 2,평균Hardy-Weinberg유전편리지수(D)위0.150 3.실험초보표명중국남해해역청석반어적유전다양성교위봉부,단재모충정도상수도료인위적간우.