江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2010年
5期
75-77
,共3页
鸽%Ufm1基因%生物信息学%编码蛋白
鴿%Ufm1基因%生物信息學%編碼蛋白
합%Ufm1기인%생물신식학%편마단백
通过对鸽脑垂体cDNA文库进行筛选,获得泛素折叠蛋白(ubiquitin-fold modifier 1,Ufm1)基因的全长cDNA序列,并通过生物信息学方法对鸽Ufm1的E序列进行相关分析预测该基因编码蛋白的理化特性、翻译后的修饰位点及二级结构等.研究结果表明:Ufm1基因全长781 bp,包含1个258 bp的ORF编码85个氨基酸,该序列的GenBank登录号为EU914822.Ufm1属于非跨膜蛋白,cDNA编码的氨基酸序列发现糖基化位点4个,预测到有3个Ser和4个Thr存在潜在的磷酸化.预测此Ufm1的二级结构中β延伸链占34.1%,α螺旋占24.7%,无规则卷曲占41.2%.Ufm1基因的全长DNA序列的筛选及分析结果可为泛素-蛋白酶体通路在鸽就巢泌乳机制中作用的相关研究提供理论参考.
通過對鴿腦垂體cDNA文庫進行篩選,穫得汎素摺疊蛋白(ubiquitin-fold modifier 1,Ufm1)基因的全長cDNA序列,併通過生物信息學方法對鴿Ufm1的E序列進行相關分析預測該基因編碼蛋白的理化特性、翻譯後的脩飾位點及二級結構等.研究結果錶明:Ufm1基因全長781 bp,包含1箇258 bp的ORF編碼85箇氨基痠,該序列的GenBank登錄號為EU914822.Ufm1屬于非跨膜蛋白,cDNA編碼的氨基痠序列髮現糖基化位點4箇,預測到有3箇Ser和4箇Thr存在潛在的燐痠化.預測此Ufm1的二級結構中β延伸鏈佔34.1%,α螺鏇佔24.7%,無規則捲麯佔41.2%.Ufm1基因的全長DNA序列的篩選及分析結果可為汎素-蛋白酶體通路在鴿就巢泌乳機製中作用的相關研究提供理論參攷.
통과대합뇌수체cDNA문고진행사선,획득범소절첩단백(ubiquitin-fold modifier 1,Ufm1)기인적전장cDNA서렬,병통과생물신식학방법대합Ufm1적E서렬진행상관분석예측해기인편마단백적이화특성、번역후적수식위점급이급결구등.연구결과표명:Ufm1기인전장781 bp,포함1개258 bp적ORF편마85개안기산,해서렬적GenBank등록호위EU914822.Ufm1속우비과막단백,cDNA편마적안기산서렬발현당기화위점4개,예측도유3개Ser화4개Thr존재잠재적린산화.예측차Ufm1적이급결구중β연신련점34.1%,α라선점24.7%,무규칙권곡점41.2%.Ufm1기인적전장DNA서렬적사선급분석결과가위범소-단백매체통로재합취소비유궤제중작용적상관연구제공이론삼고.
