生态学报
生態學報
생태학보
ACTA ECOLOGICA SINICA
2003年
10期
2170-2175
,共6页
罗海峰%齐鸿雁%薛凯%王晓谊%王川%张洪勋
囉海峰%齊鴻雁%薛凱%王曉誼%王川%張洪勛
라해봉%제홍안%설개%왕효의%왕천%장홍훈
PCR-DGGE%微生物多样性%GC发卡结构
PCR-DGGE%微生物多樣性%GC髮卡結構
PCR-DGGE%미생물다양성%GC발잡결구
应用普通细胞裂解法提取3株实验菌株(Escherichia coli DH 5α, Staphylococcusaureus SA-1和Agrobacterium tumerfaciens 13129)的基因组DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取7种不同土壤样品中的微生物的基因组DNA,两组不同结构的引物F357GC,R518(在正向引物的5′端有GC发卡结构)和F357,R518,分别对实验菌株和土壤样品中微生物的16S rRNA基因V3区进行扩增,均得到了目的片段.比较了不同引物扩增的16S r DNA片段在DGGE中的不同电泳行为,结果表明,含GC发卡结构的PCR扩增产物在DGGE中能够得到很好的分离,而无GC发卡结构的PCR产物则不能在DGGE中获得满意分离.引入GC发卡结构,使得对不同微生物的定性和分类更深入细致.
應用普通細胞裂解法提取3株實驗菌株(Escherichia coli DH 5α, Staphylococcusaureus SA-1和Agrobacterium tumerfaciens 13129)的基因組DNA和應用基于高鹽和長時高熱的細胞裂解法提取7種不同土壤樣品中的微生物的基因組DNA,兩組不同結構的引物F357GC,R518(在正嚮引物的5′耑有GC髮卡結構)和F357,R518,分彆對實驗菌株和土壤樣品中微生物的16S rRNA基因V3區進行擴增,均得到瞭目的片段.比較瞭不同引物擴增的16S r DNA片段在DGGE中的不同電泳行為,結果錶明,含GC髮卡結構的PCR擴增產物在DGGE中能夠得到很好的分離,而無GC髮卡結構的PCR產物則不能在DGGE中穫得滿意分離.引入GC髮卡結構,使得對不同微生物的定性和分類更深入細緻.
응용보통세포렬해법제취3주실험균주(Escherichia coli DH 5α, Staphylococcusaureus SA-1화Agrobacterium tumerfaciens 13129)적기인조DNA화응용기우고염화장시고열적세포렬해법제취7충불동토양양품중적미생물적기인조DNA,량조불동결구적인물F357GC,R518(재정향인물적5′단유GC발잡결구)화F357,R518,분별대실험균주화토양양품중미생물적16S rRNA기인V3구진행확증,균득도료목적편단.비교료불동인물확증적16S r DNA편단재DGGE중적불동전영행위,결과표명,함GC발잡결구적PCR확증산물재DGGE중능구득도흔호적분리,이무GC발잡결구적PCR산물칙불능재DGGE중획득만의분리.인입GC발잡결구,사득대불동미생물적정성화분류경심입세치.
