口腔医学
口腔醫學
구강의학
STOMATOLOGY
2011年
3期
144-147,161
,共5页
刘莹%吴明桃%陈慧%庞小燕%赵立平%唐子圣
劉瑩%吳明桃%陳慧%龐小燕%趙立平%唐子聖
류형%오명도%진혜%방소연%조립평%당자골
DNA提取%变性剂梯度凝胶电泳%龈上菌斑
DNA提取%變性劑梯度凝膠電泳%齦上菌斑
DNA제취%변성제제도응효전영%간상균반
目的 寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法.方法 采用洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法 进行评价.结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处.Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低.X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异.X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低.结论 洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差.
目的 尋找方便、快捷、經濟、穫取細菌信息量最多的細菌基因組DNA抽提方法.方法 採用洗滌+凍融+Bead Beater+酚氯倣抽提法(X法)、試劑盒法(Y法)、洗滌+凍融+試劑盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100後煮沸法(V法)5種DNA抽提方法,分彆提取3例慢性牙週炎患者齦上菌斑DNA,檢測DNA片段大小和濃度;同時運用變性梯度凝膠電泳分析樣本微生物多樣性和相似度,從多箇角度對5種DNA提取方法 進行評價.結果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp處;Y法和Z法DNA片段均勻分佈于500～20 000 bp處;U法無明顯DNA片段齣現;V法DNA片段主要分佈于500～2 000 bp處.Y法、Z法與V法所提DNA濃度較高,X法與U法所提DNA濃度較低.X法、Y法、Z法和V法反應的齦上菌斑微生物多樣性無顯著差異.X法、Y法和Z法的相似度較高,而V法與X法、Y法、Z法的相似度較低.結論 洗滌+凍融+Bead Beater+酚氯倣抽提法,試劑盒法,洗滌+凍融+試劑盒法,加Chelex-100後煮沸法的DNA提取效果無顯著差異;直接煮沸法的DNA提取效果較差.
목적 심조방편、쾌첩、경제、획취세균신식량최다적세균기인조DNA추제방법.방법 채용세조+동융+Bead Beater+분록방추제법(X법)、시제합법(Y법)、세조+동융+시제합법(Z법)、직접자비법(U법)화가Chelex-100후자비법(V법)5충DNA추제방법,분별제취3례만성아주염환자간상균반DNA,검측DNA편단대소화농도;동시운용변성제도응효전영분석양본미생물다양성화상사도,종다개각도대5충DNA제취방법 진행평개.결과 X법DNA편단집중우3 000～20 000bp처;Y법화Z법DNA편단균균분포우500～20 000 bp처;U법무명현DNA편단출현;V법DNA편단주요분포우500～2 000 bp처.Y법、Z법여V법소제DNA농도교고,X법여U법소제DNA농도교저.X법、Y법、Z법화V법반응적간상균반미생물다양성무현저차이.X법、Y법화Z법적상사도교고,이V법여X법、Y법、Z법적상사도교저.결론 세조+동융+Bead Beater+분록방추제법,시제합법,세조+동융+시제합법,가Chelex-100후자비법적DNA제취효과무현저차이;직접자비법적DNA제취효과교차.
