CAJ | 학술논문

对鸡脂肪性状候选基因进行连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析可以为理解鸡体脂沉积的遗传学机制提供重要信息,并且可以提高脂肪性状相关分子遗传标记的检出效率.本研究以东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系第8世代肉仔鸡为实验材料,通过直接测序、高效液相色谱(DHPLC)、单链构象多态性(PCR-sscv)、限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、长度多态性(PCR-LP)等方法对过氧化物酶增殖体激活受体(PPAR-γ)、载脂蛋白B(ApoB)、解耦联蛋白(UCD)以及其他10个鸡脂肪性状重要候选基因进行多态性检测,计算候选基因标记间LD参数∣D'∣与r2,分析这些候选基因标记间的LD模式并探讨其规律.初步发现了以下特征:1、在各候选基因内,标记间的∣D'∣与r2值并不匹配,取值区间差异很大,∣D'∣值普遍大于r2;另外,在有些基因内的相同标记间,∣D'∣、r2值相差很大,甚至在∣D'∣=1时,r2接近于0.2、在不同基因甚至在同一基因内不同区域LD水平差异很大且物理距离与LD关系并不成线性关系.3、在有些基因内,如ApoB基因,相间位点间的∣D'∣和r2值大于相邻位点间的值.4、有些基因,如PPAR4-γ,相同标记间LD水平在高、低脂系间存在很大差异.本研究结果提示,在群体遗传学研究中进行候选基因LD分析时,LD参数r2的应用价值比∣D'∣更大.
대계지방성상후선기인진행련쇄불평형(linkage disequilibrium,LD)분석가이위리해계체지침적적유전학궤제제공중요신식,병차가이제고지방성상상관분자유전표기적검출효솔.본연구이동북농업대학육계고、저지쌍향선택품계제8세대육자계위실험재료,통과직접측서、고효액상색보(DHPLC)、단련구상다태성(PCR-sscv)、한제성편단장도다태성(PCR-RFLP)、장도다태성(PCR-LP)등방법대과양화물매증식체격활수체(PPAR-γ)、재지단백B(ApoB)、해우련단백(UCD)이급기타10개계지방성상중요후선기인진행다태성검측,계산후선기인표기간LD삼수∣D'∣여r2,분석저사후선기인표기간적LD모식병탐토기규률.초보발현료이하특정:1、재각후선기인내,표기간적∣D'∣여r2치병불필배,취치구간차이흔대,∣D'∣치보편대우r2;령외,재유사기인내적상동표기간,∣D'∣、r2치상차흔대,심지재∣D'∣=1시,r2접근우0.2、재불동기인심지재동일기인내불동구역LD수평차이흔대차물리거리여LD관계병불성선성관계.3、재유사기인내,여ApoB기인,상간위점간적∣D'∣화r2치대우상린위점간적치.4、유사기인,여PPAR4-γ,상동표기간LD수평재고、저지계간존재흔대차이.본연구결과제시,재군체유전학연구중진행후선기인LD분석시,LD삼수r2적응용개치비∣D'∣경대.