安徽大学学报(自然科学版)
安徽大學學報(自然科學版)
안휘대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF ANHUI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES EDITION)
2012年
2期
88-94
,共7页
屠云洁%苏一军%王克华%张学余%李国辉%殷建玫
屠雲潔%囌一軍%王剋華%張學餘%李國輝%慇建玫
도운길%소일군%왕극화%장학여%리국휘%은건매
鸡%多样性%MHC%进化
鷄%多樣性%MHC%進化
계%다양성%MHC%진화
以我国9个地方鸡为研究对象,对其MHC B-G座位全基因序列进行测序,以揭示这9个地方鸡种MHC B -G基因的遗传多样性,并构建其系统进化树.结果表明,9个地方鸡种MHC B-G基因序列具有较高的遗传多样性,在9个地方鸡种中共存在666个突变位点,其中单一位点突变554个,简约信息112个,共缺失782 bp.核苷酸多样度(Pi)为0.03079±0.004 39,平均核昔酸差异(K)为182.639.9个地方鸡品种为9个单倍型,单倍型多样度为1.00±0.052.9个鸡种MHC B-G基因Kiumura双参数遗传距离范围为0.010~0.070,鹿苑鸡与新狼山鸡的遗传距离最小,为0.010;茶花鸡与东乡绿壳蛋鸡遗传距离最大,为0.070.根据9个鸡品种MHC B-G基因全序列构建的NJ树和ME树,茶花鸡单独聚为1类,其他8个品种被聚为2大类.Tajima's D值为-1.5546,且差异不显著(0.10>P>0.05),说明MHC B -G基因为负向选择,不遵循中性进化理论,MHC B -G基因多态性不是遗传漂变的结果,而是自然选择和人工选择的结果.
以我國9箇地方鷄為研究對象,對其MHC B-G座位全基因序列進行測序,以揭示這9箇地方鷄種MHC B -G基因的遺傳多樣性,併構建其繫統進化樹.結果錶明,9箇地方鷄種MHC B-G基因序列具有較高的遺傳多樣性,在9箇地方鷄種中共存在666箇突變位點,其中單一位點突變554箇,簡約信息112箇,共缺失782 bp.覈苷痠多樣度(Pi)為0.03079±0.004 39,平均覈昔痠差異(K)為182.639.9箇地方鷄品種為9箇單倍型,單倍型多樣度為1.00±0.052.9箇鷄種MHC B-G基因Kiumura雙參數遺傳距離範圍為0.010~0.070,鹿苑鷄與新狼山鷄的遺傳距離最小,為0.010;茶花鷄與東鄉綠殼蛋鷄遺傳距離最大,為0.070.根據9箇鷄品種MHC B-G基因全序列構建的NJ樹和ME樹,茶花鷄單獨聚為1類,其他8箇品種被聚為2大類.Tajima's D值為-1.5546,且差異不顯著(0.10>P>0.05),說明MHC B -G基因為負嚮選擇,不遵循中性進化理論,MHC B -G基因多態性不是遺傳漂變的結果,而是自然選擇和人工選擇的結果.
이아국9개지방계위연구대상,대기MHC B-G좌위전기인서렬진행측서,이게시저9개지방계충MHC B -G기인적유전다양성,병구건기계통진화수.결과표명,9개지방계충MHC B-G기인서렬구유교고적유전다양성,재9개지방계충중공존재666개돌변위점,기중단일위점돌변554개,간약신식112개,공결실782 bp.핵감산다양도(Pi)위0.03079±0.004 39,평균핵석산차이(K)위182.639.9개지방계품충위9개단배형,단배형다양도위1.00±0.052.9개계충MHC B-G기인Kiumura쌍삼수유전거리범위위0.010~0.070,록원계여신랑산계적유전거리최소,위0.010;다화계여동향록각단계유전거리최대,위0.070.근거9개계품충MHC B-G기인전서렬구건적NJ수화ME수,다화계단독취위1류,기타8개품충피취위2대류.Tajima's D치위-1.5546,차차이불현저(0.10>P>0.05),설명MHC B -G기인위부향선택,불준순중성진화이론,MHC B -G기인다태성불시유전표변적결과,이시자연선택화인공선택적결과.