CAJ | 학술논문

链孢粘帚霉Gliocladium catenulatum是一种重要的菌寄生真菌,为了明确该菌与寄主核盘菌Sclerotinia sclerotiorum互作中参与菌寄生过程的功能基因,本实验室前期采用抑制消减杂交技术(SSH)构建了消减cDNA文库.本文从该库里随机挑选420个阳性克隆进行测序分析,结果表明克隆片段大小在200～600bp的序列占81.07%.去除载体和小于100bp的序列,获得391条有效序列,其平均长度为409bp.通过序列拼接得到181个单值基因(unigenes),其中包括27个重叠群(contigs)和154个单拷贝的ESTs(singletons).将得到的ESTs与NCBI非冗余蛋白数据库(NR)进行BLASTx分析,结果显示有38个基因的编码蛋白与已知功能的蛋白有较高的相似性,其中包括可能与生物防治功能相关的内切葡聚糖酶、脂滴包被蛋白、MFS转运蛋白、过氧化物酶等;有39条序列在NCBI数据库中未找到相似序列,可能为新基因;其他基因的编码蛋白与数据库中功能未知蛋白相似性高.本研究为明确与重寄生功能相关的基因奠定了基础.
련포점추매Gliocladium catenulatum시일충중요적균기생진균,위료명학해균여기주핵반균Sclerotinia sclerotiorum호작중삼여균기생과정적공능기인,본실험실전기채용억제소감잡교기술(SSH)구건료소감cDNA문고.본문종해고리수궤도선420개양성극륭진행측서분석,결과표명극륭편단대소재200～600bp적서렬점81.07%.거제재체화소우100bp적서렬,획득391조유효서렬,기평균장도위409bp.통과서렬병접득도181개단치기인(unigenes),기중포괄27개중첩군(contigs)화154개단고패적ESTs(singletons).장득도적ESTs여NCBI비용여단백수거고(NR)진행BLASTx분석,결과현시유38개기인적편마단백여이지공능적단백유교고적상사성,기중포괄가능여생물방치공능상관적내절포취당매、지적포피단백、MFS전운단백、과양화물매등;유39조서렬재NCBI수거고중미조도상사서렬,가능위신기인;기타기인적편마단백여수거고중공능미지단백상사성고.본연구위명학여중기생공능상관적기인전정료기출.