CAJ | 학술논문

背景:人类白细胞抗原基因测序分型中,当等位基因的差异碱基位于测序范围之外或不同等位基因对的杂合序列相同时,无法得到清晰的结果.目的:通过完整外显子2/3序列的测定,解决常规HLA-DRB1基因分型中的高比例歧义结果.方法:初次分型采用常规的测序方法检测320份样本的HLA-DRB1外显子2第一高变区以外的序列,测序反应设置codon86.后期采用一次性扩增外显子2/3,测序反应针对外显子2设置组特异性引物:DRB1*04/07/09为一组,其它基因家族为一组,设置conden86,对初次分型后为歧义结果的样本重新分型.结果与结论:初次分型有180份样本为歧义结果,占总样本数的56.25 %.其中A类为差异碱基位于测序范围之外,共114例;B类为等位基因对的杂合序列相同,共17例;C类为两种情况同时存在,有49例.3种类别的歧义等位基因数分别为119个、34个、98个,占等位基因总数的33.06%、9.44 %、27.22%.完整外显子2/3序列的测定使歧义结果比例从56.25%下降到14.37%,其中A类103例、B类8例、C类23例样本的等位基因得到确认.此次研究中发现了一个新等位基因,与跟它最相近的等位基因DRB1*110101相比,其外显子3的第381位碱基G>T,导致第98位氨基酸AAG(赖氨酸 Lys)>AAT(天冬酰氨 Asn).序列已提交Genbank,编号HM807583,2010-08被世界卫生组织HLA因子命名委员会命名为HLA-DRB1*1197(编号HWS10010999).提示,完整外显子2/3序列的测定能大幅降低歧义分型结果的比例.
배경:인류백세포항원기인측서분형중,당등위기인적차이감기위우측서범위지외혹불동등위기인대적잡합서렬상동시,무법득도청석적결과.목적:통과완정외현자2/3서렬적측정,해결상규HLA-DRB1기인분형중적고비례기의결과.방법:초차분형채용상규적측서방법검측320빈양본적HLA-DRB1외현자2제일고변구이외적서렬,측서반응설치codon86.후기채용일차성확증외현자2/3,측서반응침대외현자2설치조특이성인물:DRB1*04/07/09위일조,기타기인가족위일조,설치conden86,대초차분형후위기의결과적양본중신분형.결과여결론:초차분형유180빈양본위기의결과,점총양본수적56.25 %.기중A류위차이감기위우측서범위지외,공114례;B류위등위기인대적잡합서렬상동,공17례;C류위량충정황동시존재,유49례.3충유별적기의등위기인수분별위119개、34개、98개,점등위기인총수적33.06%、9.44 %、27.22%.완정외현자2/3서렬적측정사기의결과비례종56.25%하강도14.37%,기중A류103례、B류8례、C류23례양본적등위기인득도학인.차차연구중발현료일개신등위기인,여근타최상근적등위기인DRB1*110101상비,기외현자3적제381위감기G>T,도치제98위안기산AAG(뢰안산 Lys)>AAT(천동선안 Asn).서렬이제교Genbank,편호HM807583,2010-08피세계위생조직HLA인자명명위원회명명위HLA-DRB1*1197(편호HWS10010999).제시,완정외현자2/3서렬적측정능대폭강저기의분형결과적비례.