CAJ | 학술논문

背景:GPb/Ⅲa是特发性血小板减少性紫癜患者最常见的血小板糖蛋白,已证实该蛋白独特型抗体结合血小板后会激活补体,破坏血小板.目的:以GPⅡbⅢa抗体为靶抗原,应用生物信息学软件对其CTL,Th细胞表位进行多参数预测.设计、时间及地点:开放性实验,于2008-03/08在珠江医院血液科实验室完成.材料:GPⅡb/Ⅲa抗体的氨基酸序列由GENBANK公司提供.方法:分别应用SYFPEITHI,RANKPEP,BIMAS,SVMHC,PREDEP,MHCPRED,PROPRED软件对人和鼠源的血小板糖蛋白GPⅡb/Ⅲa抗体蛋白进行HLA-A*0201,HLA-A*1101,HLA-A*2401限制性表位预测,经去除能引起自身免疫的已发表的多肽,取前者覆盖后二者的多肽为混合CTL表位,再联合软件predTAP、TAPPred的TAP结合预测结果,以及NetChop、MAPPP、PAProC软件的蛋白酶切位点预测结果,取能包含二者的多肽为CTL修正表位.用基于肽MHC-Ⅱ结合的算法Syfpeithi,RANKPEP,Mhcpred,HLAPRED进行HLA-DR的Th表位预测,最后取Th表位覆盖CTL修正表位,得到CTL、Th细胞混合表位.结果:从1 740条多肽中筛选出5条人源抗人血小板糖蛋白GPⅡb/Ⅲa抗体的CTL、Th细胞混合表位肽,即Anti-GPⅡb/Ⅲa-Human的第1-15,24-38,50-64,65-81,109-121位:筛选出5条鼠源抗人血小板糖蛋白GPⅡb/Ⅲa抗体的CTL、Th细胞混合表位肽,即Anti-GPⅡb/Ⅲa-Mice的第1-15,26-40,46-60,68-82,93-107位.结论:根据血小板糖蛋白GPⅡb/Ⅲa抗体预测的CTL、Th细胞优势抗原表位,可用于制备特异性抗体,可成为特发性血小板减少性紫癜新疫苗研究的靶点.
배경:GPb/Ⅲa시특발성혈소판감소성자전환자최상견적혈소판당단백,이증실해단백독특형항체결합혈소판후회격활보체,파배혈소판.목적:이GPⅡbⅢa항체위파항원,응용생물신식학연건대기CTL,Th세포표위진행다삼수예측.설계、시간급지점:개방성실험,우2008-03/08재주강의원혈액과실험실완성.재료:GPⅡb/Ⅲa항체적안기산서렬유GENBANK공사제공.방법:분별응용SYFPEITHI,RANKPEP,BIMAS,SVMHC,PREDEP,MHCPRED,PROPRED연건대인화서원적혈소판당단백GPⅡb/Ⅲa항체단백진행HLA-A*0201,HLA-A*1101,HLA-A*2401한제성표위예측,경거제능인기자신면역적이발표적다태,취전자복개후이자적다태위혼합CTL표위,재연합연건predTAP、TAPPred적TAP결합예측결과,이급NetChop、MAPPP、PAProC연건적단백매절위점예측결과,취능포함이자적다태위CTL수정표위.용기우태MHC-Ⅱ결합적산법Syfpeithi,RANKPEP,Mhcpred,HLAPRED진행HLA-DR적Th표위예측,최후취Th표위복개CTL수정표위,득도CTL、Th세포혼합표위.결과:종1 740조다태중사선출5조인원항인혈소판당단백GPⅡb/Ⅲa항체적CTL、Th세포혼합표위태,즉Anti-GPⅡb/Ⅲa-Human적제1-15,24-38,50-64,65-81,109-121위:사선출5조서원항인혈소판당단백GPⅡb/Ⅲa항체적CTL、Th세포혼합표위태,즉Anti-GPⅡb/Ⅲa-Mice적제1-15,26-40,46-60,68-82,93-107위.결론:근거혈소판당단백GPⅡb/Ⅲa항체예측적CTL、Th세포우세항원표위,가용우제비특이성항체,가성위특발성혈소판감소성자전신역묘연구적파점.