中国畜牧兽医
中國畜牧獸醫
중국축목수의
CHINA ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2012年
10期
87-90
,共4页
禽流感病毒%HA基因序列%开放阅读框%遗传进化分析
禽流感病毒%HA基因序列%開放閱讀框%遺傳進化分析
금류감병독%HA기인서렬%개방열독광%유전진화분석
本研究于2011年8月从山东省某鸡场鸡群中分离一株病毒,通过对分离株进行病毒血凝试验及血凝抑制试验、RT-PCR、动物回归试验等方法证实已分离到禽流感病毒(avian influenza virus,AIV) H9N2,命名为WUDI-H9N2株.根据GenBank上发表的AIV H9病毒的HA基因序列,用Olig0 6.0生物学软件设计引物,对分离株WUDI-H9N2株HA基因进行扩增、测序及序列分析.将分离的AIV H9毒株与其他血清型代表参考毒株分别进行核苷酸和氨基酸系统发生进化关系分析.WUDI-H9N2株HA基因全序列长为1708 bp,无核苷酸的插入和缺失,cDNA包含了1个完整的开放阅读框(ORF),编码区由1683 bp组成,共编码560个氨基酸.HA序列与国内参考毒株的核苷酸序列的同源性在92.9％～98.1％之间,其中与安徽分离株A/chicken/China/AH-10-012010( H9N2)同源性为98.1％.
本研究于2011年8月從山東省某鷄場鷄群中分離一株病毒,通過對分離株進行病毒血凝試驗及血凝抑製試驗、RT-PCR、動物迴歸試驗等方法證實已分離到禽流感病毒(avian influenza virus,AIV) H9N2,命名為WUDI-H9N2株.根據GenBank上髮錶的AIV H9病毒的HA基因序列,用Olig0 6.0生物學軟件設計引物,對分離株WUDI-H9N2株HA基因進行擴增、測序及序列分析.將分離的AIV H9毒株與其他血清型代錶參攷毒株分彆進行覈苷痠和氨基痠繫統髮生進化關繫分析.WUDI-H9N2株HA基因全序列長為1708 bp,無覈苷痠的插入和缺失,cDNA包含瞭1箇完整的開放閱讀框(ORF),編碼區由1683 bp組成,共編碼560箇氨基痠.HA序列與國內參攷毒株的覈苷痠序列的同源性在92.9％～98.1％之間,其中與安徽分離株A/chicken/China/AH-10-012010( H9N2)同源性為98.1％.
본연구우2011년8월종산동성모계장계군중분리일주병독,통과대분리주진행병독혈응시험급혈응억제시험、RT-PCR、동물회귀시험등방법증실이분리도금류감병독(avian influenza virus,AIV) H9N2,명명위WUDI-H9N2주.근거GenBank상발표적AIV H9병독적HA기인서렬,용Olig0 6.0생물학연건설계인물,대분리주WUDI-H9N2주HA기인진행확증、측서급서렬분석.장분리적AIV H9독주여기타혈청형대표삼고독주분별진행핵감산화안기산계통발생진화관계분석.WUDI-H9N2주HA기인전서렬장위1708 bp,무핵감산적삽입화결실,cDNA포함료1개완정적개방열독광(ORF),편마구유1683 bp조성,공편마560개안기산.HA서렬여국내삼고독주적핵감산서렬적동원성재92.9％～98.1％지간,기중여안휘분리주A/chicken/China/AH-10-012010( H9N2)동원성위98.1％.
